University of Groningen
Biochemical characterization and bioinformatic analysis of two large multi-domain enzymes
from Microbacterium aurum B8.A involved in native starch degradation
Valk, Vincent
IMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF) if you wish to cite from
it. Please check the document version below.
Document Version
Publisher's PDF, also known as Version of record
Publication date:
2017
Link to publication in University of Groningen/UMCG research database
Citation for published version (APA):
Valk, V. (2017). Biochemical characterization and bioinformatic analysis of two large multi-domain enzymes
from Microbacterium aurum B8.A involved in native starch degradation. Rijksuniversiteit Groningen.
Copyright
Other than for strictly personal use, it is not permitted to download or to forward/distribute the text or part of it without the consent of the author(s) and/or copyright holder(s), unless the work is under an open content license (like Creative Commons).
Take-down policy
If you believe that this document breaches copyright please contact us providing details, and we will remove access to the work immediately and investigate your claim.
Downloaded from the University of Groningen/UMCG research database (Pure): http://www.rug.nl/research/portal. For technical reasons the number of authors shown on this cover page is limited to 10 maximum.
1. Enzymen die op koolhydraten werken hebben oppervlaktebindingssites (SBS) of koolhydraatbindingsdomeinen (CBM) nodig om actief te zijn op onoplosbare substraten.
2. MaAmyA en MaAmyB in Microbacterium aurum B8.A zijn evolutionair afkomstig van streptomyceten en zijn ontstaan door heterologe gen overdracht, domein duplicaties en herschikking van domeinen.
3. Het feit dat in GH13_42 enzymen additionele domeinen altijd N-terminaal geplaatst zijn ten opzichte van het katalytische domein, suggereert dat de functie van de C-regio van het katalytische domein belemmerd zou (kunnen) worden door additionele domeinen aan de C-terminus.
4. FNIII domeinen in koolhydraat gerelateerde enzymen fungeren als flexibele linker. 5. Inzichten en conclusies gebaseerd op (vroege) bioinformatica data zijn niet altijd
houdbaar met de huidige data, daarom moet meer aandacht komen voor het omgaan met (oudere) bioinformatica data in de wetenschap.
6. Het belang van goede controles (zowel positief als negatief) in experimenten wordt vaak onderschat.
7. De gebruikte materialen en methoden voor het onderzoek zijn een essentieel onderdeel van een publicatie en zouden daarom ook volledig en volwaardig in die publicatie moeten worden weer gegeven.
8. Het huidige systeem waarbij wetenschappers vooral worden beoordeeld aan de hand van hoeveel artikelen ze publiceren, en de hoogte van hun impact factor, beloont wetenschappers onvoldoende voor hun bijdrage aan het wetenschappelijk onderwijs.
9. Binnen de huidige richtlijnen voor het intrekken van artikelen zijn er onvoldoende consequenties voor het publiceren van onjuiste data, waardoor zelfkritisch onderzoek niet wordt gestimuleerd.
10. Het wetenschappelijk niveau van HLO studenten wordt op de universiteit vaak onderschat.
11. Hoewel bescheidenheid de mens siert, leidt het in de wetenschap snel tot onderwaardering.
12. Studenten die in tweetallen samenwerken aan een project hoeven niet per definitie dezelfde beoordeling te krijgen.
Stellingen
Behorend bij het proefschrift
