Damage recognition in nucleotide excision repair
Malta, E.
Citation
Malta, E. (2008, December 9). Damage recognition in nucleotide excision repair. Retrieved from https://hdl.handle.net/1887/13327
Version: Corrected Publisher’s Version
License: Licence agreement concerning inclusion of doctoral thesis in the Institutional Repository of the University of Leiden
Downloaded from: https://hdl.handle.net/1887/13327
Note: To cite this publication please use the final published version (if applicable).
157
Curriculum vitae
De auteur van dit proefschrift werd op 22 september 1980 te Vlaardingen geboren. In Schiedam doorliep hij het Gymnasium aan s.g. Spieringshoek welke in 1998 met goed gevolg werd afgerond. In september van datzelde jaar werd begonnen met de studie scheikunde aan de Universiteit Leiden. Tijdens deze opleiding liep hij zijn hoofdvakstage bij de afdeling Moleculaire Genetica onder leiding van dr. N. Goosen en prof. dr. J. Brouwer. In februari 2004 behaalde hij het doctoraal examen en werd er per 1 maart 2004 begonnen aan een promotie-onderzoek. Dit onderzoek werd uitgevoerd aan de afdeling Moleculaire Genetica wederom onder leiding van dr. N. Goosen en prof. dr. J. Brouwer en staat beschreven in dit proefschrift.
Per 1 november 2008 is hij werkzaam als post-doc bij de afdeling Toxicogenetica van het Leids Universitair Medisch Centrum onder leiding van dr. H. Van Attikum en prof.
dr. L. H. F. Mullenders.
158
List of publications
Malta, E., Moolenaar, G.F. and Goosen N. (2006) Base flipping in nucleotide excision repair. J. Biol. Chem., 281, 2184-2194.
Malta, E., Moolenaar, G.F. and Goosen, N. (2007) Dynamics of the UvrABC nucleotide excision repair proteins analyzed by fluorescence resonance energy transfer. Biochemistry, 46, 9080-9088.
Malta, E., Verhagen, C.P., Moolenaar, G.F., Filippov, D.V., van der Marel, G.A. and Goosen, N. (2008) Functions of base flipping in E. coli nucleotide excision repair. DNA repair, 7, 1647-1658.
159
Dankwoord
Een promotie-onderzoek doe je natuurlijk niet alleen en nu er een einde komt aan deze periode is er even tijd om stil te staan bij de mensen zonder wie dit proefscrift waarschijnlijk nooit tot stand was gekomen.
In de eerste plaats, hoe kan het ook anders, Geri en Nora. Nora ik wil jou bedanken voor je wetenschappelijke begeleiding. Jij hebt me veel geleerd over het doen van onderzoek en ik was altijd verbaasd hoe snel onze discussies mij weer tot nieuwe inzichten brachten over de te volgen koers. Geri, jij en jij alleen hebt mij de praktische kant van het onderzoek bijgebracht. Jouw schat aan ervaring in het lab en de vele praktische tips die ik van jou heb gehad hebben een zeer belangrijke bijdrage geleverd, niet alleen aan dit werk maar ook voor de rest van mijn carriëre. De vraag ‘hoe zou Geri dit aanpakken?’ is mij vaak door het hoofd geschoten. Marian, ook jij een bent een belangrijke factor geweest in dit onderzoek en niet alleen vanwege jouw, door mij geliefde, muziekkeuze. Niet alleen je hulp in het lab maar ook als ik weer eens vast zat met het onderzoek was jij er altijd om even aan te horen wat het probleem was. Tevens fungeerde jij als uitlaatklep, om al mijn ongenoegen te spuien als dingen weer eens niet gingen zoals ik dat zou willen. Keti, ‘having in mind our occupation’Keti, ‘having in mind our occupation’
we often faced the same problems and in these times it was you who I could turn to for advice.
Also on the more personal level you were always there to help me. Thanks a lot for that!Thanks a lot for that!
Naast deze vaste waarden in het lab wil ik ook twee andere belangrijke personen even in het bijzonder bedanken, mijn paranimfen. Voor hun was niet alleen een belangrijke taak weggelegd tijdens de afgelopen periode maar ook tijdens de verdediging van dit proefschrift. Koen, samen hebben wij meer dan 10 jaar op het Gorlaeus overleefd (vraag niet hoe...), waarvan de laatste vier jaar, op het lab, als vrienden. Jouw aanwezigheid in dit lab vol vrouwen heeft mij veel geholpen en ook al was je altijd druk je had altijd even tijd om mij te helpen met het één of ander. Ook jij Mass, verdient een bijzonder bedankje. Al kennen we elkaar nog niet zo heel erg lang, ik heb nu al veel aan je te danken en ik hoop dat dit het begin is van een lange vriendschap. Ik vind het een eer om naast jou plaats te mogen nemen in de langste 45 minuten van mijn leven.
Veel van het werk beschreven in dit proefschrift is mij uit handen genomen door een aantal studenten met wie ik met veel plezier heb samengewerkt. In order of appearance waren dit: John, Erik, Elisabeth en Angela. Jullie hebben allen veel voor mij betekend en hebben mij minstens zoveel geleerd.
Tevens vind ik dat de uitzonderlijke prestatie van de mensen van de keuken wel eens genoemd mag worden. Jan, Helen en Annelies, zonder jullie werk was ik nu nog lang niet klaar geweest.
Ook wil ik de rest van de molgen groep bedanken en dan met name Riekje, Tineke, Hans, Ben, Ana, Patrick, Jaap, Backy, Maarten en Wilbert.
De samenwerking met de Bio-organische synthese groep is mij ook altijd zeer goed bevallen. Ik heb met name veel te danken gehad aan het goede werk van en de discussies
160
met Carlo, Dima en Gijs. Maar ook de studenten die hebben geholpen met de synthese wil ik hierbij graag bedanken.
Tot zover de mensen die direct bij het werk betrokken waren maar er zijn natuurlijk ook een heleboel mensen te noemen die achter de schermen indirect een invloed hebben gehad op de totstandkoming van dit proefschrift. Als eerste wil ik mijn vader bedanken voor het steunen en respecteren van mijn keuzes en voor het vormen van de persoon die ik vandaag ben. Ook mijn zusje (Karen), Alie en de rest van mijn familie hebben hierbij een belangrijke rol gespeeld en verdienen het om in dit proefschrift vereeuwigd te worden.
Mijn vrienden waren ook niet onbelangrijk in deze periode en deze wil ik dan ook even uitgebreid bedanken. Dennis v. L., Dennis D. en Axel, jullie vriendschap dateert al van ver voor mijn promotie-tijd en heeft me al door heel wat diepe dalen heen gesleept. Ik ben nog steeds van mening Axel dat we Pi-2 moeten patenteren... Additionally, I would likeAdditionally, I would like to thank some of my more recent friends. Cristiana and Mass (again), our meetings always help(ed) me to re-focus my attention and our movie nights are already unforgettable. Kasia and Sakis, you were always there for me and helped me out in so many ways. Also we share the same idea about doing parties at home. It is a privilege to know you both. Ula and Fabio, even though we didn’t get to know each other so well (yet), which I am sure will happen when our new homes don’t consume all of our attention, I consider myself lucky that I know you. And finally, Pikacz and Mi, even though you are far away, your friendship means a lot to me showing that good friendship knows no borders.
Ook die personen die ik als vrienden beschouw en die hier niet genoemd staan verdienen natuurlijk een bedankje. Dit zijn er helaas meer dan ik hier op kan noemen maar zij die ontbreken weten zelf wel wie ik bedoel.
En tot slot een woord van dank voor mijn steun en toeverlaat, moja kochana Agatka.
I want to thank you above all a lot for all the support and love you gave me over these years and the role you have played in my life. You have always given me the strength to continue even though times were not always easy on us. Dziękuję bardzo za to i za dużo więcej.
