Functional protein networks unifying limb girdle muscular dystrophy
Morrée, A. de
Citation
Morrée, A. de. (2011, January 12). Functional protein networks unifying limb girdle muscular dystrophy. Retrieved from https://hdl.handle.net/1887/16329
Version: Corrected Publisher’s Version
License: Licence agreement concerning inclusion of doctoral thesis in the Institutional Repository of the University of Leiden
Downloaded from: https://hdl.handle.net/1887/16329
Note: To cite this publication please use the final published version (if
applicable).
249 Curriculum Vitae
Antoine de Morrée was born in Utrecht, The Netherlands on April 27th 1982.
He attended the Montessori elementary school in Houten, and subsequently the Sint Bonifatius College in Utrecht, where he finished his VWO degree in 2000.
Thereupon, Antoine enrolled at Utrecht University where he followed the Bachelor programs of Biomedical Sciences and of Philosophy (focussing on philosophy of science and epistemology). During his Masters program he specialized in biomolecular sciences, and performed an internship at Karolinska Institutet in Stockholm, Sweden. He obtained his degree in June 2005. After a short period as a literature researcher at Crucell, Antoine started his PhD training at the Leiden University Medical Center, at the department of human genetics, under supervision of professors Silvère van der Maarel and Rune Frants.
This dissertation thesis describes the efforts of this training period.
In addition to his research Antoine deployed numerous activities, including the chairing of VvE Het Augustinushof, organization of a monthly meeting for the biomedical PhD students of the LUMC, and the organization of the annual PhD student retreat to Heidelberg, Germany. At the end of his PhD funding Antoine successfully applied for a one-year post-doctoral grant of the Jain Foundation, which allowed him to finish his work. During his work Antoine attended numerous national and international conferences, was awarded the poster prize at the fourth annual Dysferlin meeting, and was selected for oral presentation at the WMS 2009 in Geneva and the New Directions meeting in Ottawa 2010.
After his PhD degree, Antoine will move to Stanford, Palo Alto, California,
USA where he will work as a postdoctoral fellow in the lab of professor Tom
Rando. Antoine will stay in the muscle research field, but move towards satellite
cells, which are the adult stem cells that lend the skeletal muscle its amazing
regenerative capacity.
251 Pulication list
1. de Morrée A, Droog M, Bisschop IJM, Impagliazzo A, Frants RR, Klooster R, van der Maarel SM. Self-regulated alternative splicing at the AHNAK locus. Manuscript submitted
2. Gallardo E*, de Luna N*, Diaz- Manera J, Rojas-García R, Paradas C, Flix B, Gonzalez-Quereda L, Hankiewicz K, Gich I, de Morrée A, van der Maarel SM, Illa I. Dysferlin blood test as a biomarker of muscular dystrophies: clinical, genetic, and muscle biopsy studies in a case series.
Manuscript submitted
3. van Haagen HHHBM., ’t Hoen PAC, de Morrée A, van Roon-Mom WM, Peters DJ, Mons B, Schuemie MJ. Improved prediction of protein-protein interactions after integration of different biological databases.
Manuscript submitted
4. de Morrée A, Hensbergen PJ, van Haagen HHBM, Dragan I, Frants RR, van der Maarel SM. Proteomic analysis of the Dysferlin protein complex unveils its importance for sarcolemmal maintenance and integrity. PLoS ONE. 2010 Nov 5;5(11):e13854.
5. de Morrée A, Lutje Hulsik D, Impagliazzo A, van Haagen HHHBM, de Galan
P, van Remoortere A, ’t Hoen PAC, van Ommen GJB, Frants RR, van der Maarel SM. Calpain 3 is a rapid-action, unidirectional proteolytic switch central to muscle remodeling. PLoS ONE. 2010 Aug 4;5(8):e11940.
6. van Haagen HHHBM, ‘t Hoen PA, Botelho Bovo A, de Morrée A, van Mulligen EM, Chichester C, Kors JA, den Dunnen JT, van Ommen GJ, van der Maarel SM, Kern VM, Mons B, Schuemie MJ. Novel protein-protein interactions inferred from literature context.
PLoS ONE. 2009 Nov 18;4(11):e7894.
7. Huang Y*, de Morrée A*, van Remoortere A, Bushby K, Frants RR, den Dunnen J, van der Maarel SM. Calpain 3 is a modulator of the Dysferlin protein complex in skeletal muscle. Hum Mol Genet. 2008 Jun 15;17(12):1855-66.
8. Smolenaars MM, de Morrée A, Kerver J, Van der Horst DJ, Rodenburg KW.
Insect lipoprotein biogenesis depends on an amphipathic beta cluster in apolipophorin II/I and is stimulated by microsomal triglyceride transfer protein. J Lipid Res.
2007 Sep;48(9):1955-65.
* shared first authorship
253 Acknowledgements
De laatste woorden van mijn proefschrift vinden hun weg naar het papier. Een einde aan het immense, wetenschappelijk project dat mijn leven dicteerde gedurende de afgelopen 5 jaar. Nu ik terug kijk, wil ik graag een aantal mensen bedanken die mijn leven en werk sterk positief hebben beïnvloed.
Allereerst mijn ouders en zus(je). Cees en Marcelle, zonder jullie zou dit niet mogelijk zijn geweest.
Bedankt voor de onvoorwaardelijke steun waar ik het nodig had, en voor het met beide voeten op de grond houden wanneer ik mezelf dreigde te verliezen. Cecile, ik ben erg blij dat jij me wilt ondersteunen als paranimf. Misschien zul je er in de toekomst ook zelf staan. En dan ben ik er ook voor jou.
Willem-Jan, je hebt me begeleid tijdens mijn sollicitatie toen ik niet kon zien waar ik aan begon.
Het is passend dat je me nu aan het einde wederom ter zijde staat. Ik hoop dat onze persoonlijke en wetenschappelijke vriendschap nog lang zal voortduren.
Lieve Godelieve, ik prijs mezelf gelukkig dat jij naast me hebt gestaan de afgelopen jaren. Je bent mijn steun geweest; tijdens de vele late werkuren, maar ook voor de nodige ontspanning. Jij maakt mijn leven gezellig. Ik hoop dat je dat zult blijven doen in Palo Alto. Een avontuur voor ons samen.
Dank ook aan mijn vrienden, die contact hebben aangehouden ook al kwam ik vaak te laat voor afspraken (proef die uitliep, trein vertraging) of had ik geen tijd (proef die af moest): Tristan & Erna (tot gauw aan de west-coast), John (vergeet niet tijdig je boekje in te leveren!), Gineke & Marcel, Martijn, Alex, Liza, Nienke, Eef (vormgever en eftelingkenner), Ilse, Rudolf (droogijs als festivalkraker), Suzanne (ik hoop snel jouw boekje te ontvangen).
Mijn Augustinushofburen en VvE bestuursgenoten. Bedankt voor de hulp bij het smeden van onze VvE tot een geheel, het afmaken van onze prachtige complex en het aanjagen van VV en VHU.
During my internship in Stockholm I was lucky to encounter some of my best friends: Nora & Freddy, Andras (Dr. Hyde) & Zsuzsi, Katarina. I am glad we stayed in contact and hope we will keep on doing that.
Verder ben ik een hoop verschuldigd aan mijn collega’s. Mensen die me hebben bijgestaan, dag en nacht, door dik en dun. Met muziek, activiteiten, goede feedback, schouderklopjes, gedeelde smart, Big Mikes, en labhumor. Dank aan de Proteomics gang: Marko (dj Smurf, altijd een passend lied), Maarten (Klaus), Kim (ik heb veel van je geleerd), Ilona (op onze volgende vruchtbare samenwerking), Laure (finish that jaw breaker!), Rinse (die golfcup hoort bij Proteomics!), Jeroen, Smiriti, Marjolijn, Paula
(AHNAKje heeft het als naam niet gered, maar het aapje zit nog in de boom), Maartje (het volgende
‘briljantje’ is vast raak), Antonietta, Huang (thanks for introducing me to AHNAK).
Mijn werk zou aanzienlijk minder leuk en succesvol zijn geweest zonder “mijn” studenten. Marjolein, Christian, Ivana en Marlinde, heel erg bedankt voor jullie vertrouwen en ondersteuning, en voor het interessant maken van mijn werkdagen door jullie ontoombare enthousiasme, talent voor het creëren van onmogelijke problemen, en vermogen tot het leveren van goede experimentele resultaten. Ik denk dat jullie allevier een fantastische toekomst tegemoet zien.
Dank ook aan de overige (spier)kracht van het Maarel lab, FSHD en OPMD. Yvonne (Gezellig!), Peter (jaah hoor!, April Fool’s day), Karlien, Wang, Jessica, Vered, Sabine, Andrea, Yahya, Bianca (Karaoke!), Patrick (op naar #12), Richard, Corrie, Kirsten (wedden dat ik geen gewicht aankom?), Judit, Ellen.
En tot slot de resterende lab Frants, HKG en LUMC collega’s. Teveel om allemaal op te noemen.
Andre, Anita en Babs, altijd beschikbaar voor hulp en vragen. AG, bedankt voor je adviezen. Peter-Bram, bedankt voor al je nuttige commentaren en suggesties. Alfred, bedankt voor je hulp bij het tackelen van spier SUMO. Arnoud, bedankt voor de Dysferline gesprekken. Ollie, there is nothing like a good western blot. Ton, bedankt dat ik mocht meefilosoferen over de Graduate School.
Tijdens mijn werk heb ik veel georganiseerd met andere talentvolle onderzoekers, waaronder de Heidelberg aio retraite (Erik, Diederik, Berina, Laura, Madeleine, Astrid, Saskia, Anika), en de maandelijkse aio pizza meeting (Godelieve, Asta-Björk, Petra, Dwi, Ivo, Rudolf, Dimitris). Bedankt.
Plavi and the Jain Foundation, thanks for your continuous support. My internship tutors Essam, Lisa, Per-Olof, Dick, Kees, Marcel, thanks for preparing me for this research project. Thank to my numerous international collaborators, especially Isabel, Eduard, Kate, Steve, Richard, Rita, Melissa, Jaques.
Thanks to the LGMD & Dysferlinopathy patients who are truly a source of inspiration.
Tot slot mijn promotores, Rune en Silvère. Rune, een man van weinig woorden. Bedankt voor je vertrouwen en rake commentaren. Silvère, je hebt een fantastische ruimte gecreëerd waarin ik me heb kunnen ontplooien. Je keek haast sneller na dan ik kon schrijven, had altijd een idee paraat en hebt me zonder terughoudendheid naar voren geschoven op het internationale podium. Ik heb veel van je geleerd, en hoop dat te blijven doen in de toekomst.
Mijn promotie-onderzoek heeft me alles gebracht wat ik verwacht had, en meer. Ik heb ongelooflijk veel geleerd, heb steevast mijn grenzen verlegd, heb interessante mensen ontmoet en de wereld rond gereisd.
En dat alles terwijl ik me bezig hield met wetenschappelijke vraagstukken die me enorm interesseerden, en zullen blijven interesseren. Als klap op de vuurpijl heb ik een nieuw eiwit ontdekt, gekarakteriseerd, en een naam gegeven. Kan het nog beter dan dit? Of loop ik het risico te vallen in het bekende “zwarte gat”, nu het hogere doel van de promotie, de drijvende kracht van de afgelopen jaren, weg valt? Het is tijd om verder te gaan, en ik kijk uit naar mijn toekomst in Palo Alto, die ongetwijfeld nieuwe verrassende ontmoetingen zal brengen met mensen, cultuur en wetenschap. Met andere woorden: Bijna maandag!
