Appendix C1. Primers for novel Vitis vinifera miRNA stemloop RT-qPCRs.
Primer Sequence Amplicon size Target Primer concentration Annealing temperature Reference
vvi-miR167a_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACCAGATC vvi-miR167a vvi-miR167a_F TCGCGTGAAGCTGCCAGCAT 60 0.6 µM 60 °C [40] vvi-miR159c_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACTAGAGC vvi-miR159c vvi-miR159c_F CGGCGGTTTGGATTGAAGGGA 61 0.6 µM 60 °C [40] Cluster_187937_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACGGTCCC c187937 Cluster_187937_F CGTCTAGCTGGAAGCCGATGG 62 0.6 µM 60 °C Cluster_130253_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACGTTCCC c130253 Cluster_130253_F CAGGTCGTTGGAAGTCGGTGG 62 0.6 µM 60 °C Cluster_130381_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACGGTCCC c130381 Cluster_130381_F CTGGTCGTTGGAAGTCGGTGG 61 0.6 µM 60 °C Cluster_40118_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACGAGGAA c40118 Cluster_40118_F CGCTATTCGGACCAGGCTTCA 61 0.6 µM 60 °C Cluster_134686_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACGGGAGC c134686 Cluster_134686_F CACCGCTTGGACTGAAGGGA 60 0.6 µM 60 °C Cluster_209490_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACCCATGC c209490 Cluster_209490_F CGCTATCGGGGACGAGGTAGT 61 0.6 µM 60 °C Cluster_31052_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACACTGAG c31052 Cluster_31052_F GGCGTACTGGCAAGTTGACTTGA 63 0.6 µM 60 °C Cluster_205570_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACGGTCCC c205570 Cluster_205570_F AATGTCGCTGGAAGCCGATGG 61 0.6 µM 60 °C Cluster_141224_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACGGTCCC c141224 Cluster_141224_F GTACGAGGTTGGAAGTCGGTGG 62 0.6 µM 60 °C Cluster_141107_UPL_RT GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAACGTTCCC c141107 Cluster_141107_F TGAGAGTTGGAAGCCGGTGG 60 0.6 µM 60 °C
Universal Reverse Primer GTGCAGGGTCCGAGGT [40]
