• No results found

University of Groningen A Tale of Two Cell Factories Neef, Jolanda

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Share "University of Groningen A Tale of Two Cell Factories Neef, Jolanda"

Copied!
13
0
0

Bezig met laden.... (Bekijk nu de volledige tekst)

Hele tekst

(1)

A Tale of Two Cell Factories

Neef, Jolanda

DOI:

10.33612/diss.99279788

IMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF) if you wish to cite from it. Please check the document version below.

Document Version

Publisher's PDF, also known as Version of record

Publication date: 2019

Link to publication in University of Groningen/UMCG research database

Citation for published version (APA):

Neef, J. (2019). A Tale of Two Cell Factories: Heterologous protein secretion in Bacillus subtilis and Lactococcus lactis. University of Groningen. https://doi.org/10.33612/diss.99279788

Copyright

Other than for strictly personal use, it is not permitted to download or to forward/distribute the text or part of it without the consent of the author(s) and/or copyright holder(s), unless the work is under an open content license (like Creative Commons).

Take-down policy

If you believe that this document breaches copyright please contact us providing details, and we will remove access to the work immediately and investigate your claim.

Downloaded from the University of Groningen/UMCG research database (Pure): http://www.rug.nl/research/portal. For technical reasons the number of authors shown on this cover page is limited to 10 maximum.

(2)

     

Chapter 10 

 

Dankwoord ‐ Acknowledgements 

Curriculum vitae 

List of publications 

 

 

 

(3)
(4)

Dankwoord ‐ Acknowledgements 

Goh, toch gek hoe het kan gaan. Ik heb altijd gezegd: “Promoveren? Nee joh, dat is niks voor mij.” En  nu zit ik hier een dankwoord voor mijn proefschrift te schrijven. Ondanks dat ik jaren heb gedacht dat  het niets voor mij zou zijn, ben ik ontzettend blij dat ik dit traject in ben gegaan. Ik heb ontzettend veel  geleerd, gedaan en beleefd. Hiervoor wil ik graag een aantal mensen speciaal bedanken.    Als eerste wil ik graag mijn promotor Jan Maarten van Dijl bedanken. Al verschillende keren hadden  we het gehad over een eventueel promotietraject maar ik hield dit altijd een beetje af, of een project  was ongeschikt. Na het afronden van het TIPharma project, en het uitblijven van een vervolgproject,  kon ik bij de Klinische Virologie aan de slag als analist (Alex Freidrich en Bert Niesters en collega’s, veel  dank daarvoor!). Doordat ik uit mijn vertrouwde onderzoeks‐omgeving werd gehaald kwam ik erachter  hoe erg research en de Moleculaire Microbiologie verweven zijn met mijzelf. Hierdoor realiseerde ik  mij ineens dat ik inderdaad een promotietraject in wilde. Ik weet nog dat we in je kamer zaten en over  het project met Genencor spraken, wat je zeer waarschijnlijk toegekend zou krijgen. Dat zou wel wat  voor mij zijn, was je idee. Je hield me op de hoogte en na een paar maanden konden we van start. Het  bleek  inderdaad  een  schot  in  de  roos.  Heel  erg  bedankt  voor  je  vertrouwen,  al  was  het  even  acclimatiseren toen bleek dat ik bij de start van de (radioactieve) pulse chase labeling experimenten  zwanger was. Wat een timing… Gelukkig benaderde je dit heel positief, zoals je dit van nature met  (bijna) alles doet, en hebben we het project met wat hulp van de grond kunnen tillen. Dit heeft een  patent en een paar mooie hoofdstukken in dit proefschrift opgeleverd. Zonder jouw hulp (inclusief de  ‘time‐management’  en  ‘chasing’  in  het  isotopenlab),  positieve  instelling  en  vertrouwen  zou  dit  proefschrift niet mogelijk zijn geweest. Heel hartelijk dank daarvoor. Ik heb ontzettend veel zin om de  komende jaren bij de Molbac groep en vooral ook bij het Bacillus werk betrokken te blijven. Ik ben  ontzettend blij dat die mogelijkheid er ook daadwerkelijk is.    Ook wil ik graag mijn co‐promotor Girbe Buist graag bedanken. We kenden elkaar natuurlijk al van de  Moleculaire Genetica groep (nog in het mooie Biologisch Centrum in Haren), waar ik mijn stage had  gelopen voor het HLO en een tijdje als analist had gewerkt. Ik weet nog goed dat ik als beginnend HLO‐ student  een  rondleiding  van  je  kreeg  op  het  lab  in  Haren  en  je  vertelde  dat  jij  als  analist  een  promotietraject had doorlopen. Dit heeft denk ik het eerste zaadje geplant; weten dat het mogelijk is  om ook als analist te promoveren. We kwamen elkaar weer tegen bij de Molbac groep. Daar hebben  we samengewerkt aan het TIPharma project, waar ik als Research analist nauw bij betrokken was. Ook  hebben  we  verschillende  practica  samen  gegeven  voor  de  Geneeskunde  en  LST  studenten.  Je  bent  altijd  enthousiast  en  hebt  veel  ideeën  om  nieuwe  projecten  te  starten.  Heel  erg  bedankt  voor  de 

(5)

prettige  overleggen  en  fijne  samenwerking.  Wat  hebben  we  een  uren  achter  de  computer  zitten  puzzelen om de introductie van dit boekje goed te krijgen! Heel erg bedankt.     Op deze plek wil ik ook graag de leden van de leescommissie, Prof. Jan Kok, Prof. Dirk‐Jan Scheffers  en Prof. Douwe van Sinderen, hartelijk danken voor het beoordelen van mijn proefschrift.     Ook veel dank voor mijn fantastische paranimfen, Sjouke en Rocío. Sjouke, onze eerste samenwerking  12 jaar (!) geleden betrof de aanschaf van een microtiterplaat reader die ook fluorescentie kon meten.  Uiteindelijk heeft dit geleidt tot de aanschaf van drie readers die nog steeds zeer frequent gebruikt  worden en tot veel publicaties hebben geleid. Nadat je een tijdje bij Westburg had gewerkt, kwam je  weer terug op het oude nest/lab en zijn we meer gaan samenwerken. Ik vind het altijd erg gezellig met  je en we hebben waardevolle discussies die gaan van de beste tactiek om een goede deal te krijgen  met  een  verkoper,  tips  en  tricks  met  betrekking  tot  het  Bacillus  werk,  tot  het  opvoeden  van  onze  kinderen. Ik vind het heel fijn dat je mijn paranimf wilt zijn op deze belangrijke dag en ik hoop dat we  nog een tijd samen mogen werken.  

Rocío,  ik  weet  dat  je  heel  graag  Nederlands  wilt  leren  en  het  ook  heel  goed  beheerst,  dus  ik  heb 

besloten om mijn dankwoord aan jou ook in het Nederlands te schrijven. Een paar jaar geleden kwam  je binnen bij de Molbac groep als mijn nieuwe studente. Tijdens ons eerste gesprek, samen met Jan  Maarten, dacht je dat het een goed idee was om de details van het project waaraan je zou gaan werken  met zijn tweetjes op een avond in de kroeg te bespreken. Dit voorstel zal ik niet snel meer vergeten.  Op dat moment reisde ik dagelijks van Groningen naar Emmen (en terug) , had een kleine vent van  bijna 2 en dus ‘s avonds niet echt meer de puf om de kroeg in te gaan. ;‐) Gedurende dit studenten‐ project hebben we ontzettend leuk samengewerkt, ondanks dat het voor jou af en toe doorbijten was  omdat de complementatie die nodig was voor je project niet heel eenvoudig bleek. Toch gaf je niet op  en bleef je rustig de verschillende extra opties uitproberen, soms gehinderd door wat frustraties. Dit  geeft wel aan hoe gedreven je bent, en ik vind het ontzettend bewonderenswaardig hoe je je eigen  PhD‐project nu een draai geeft. Zelfs Jan Maarten kan je niet altijd tegenhouden als je je zinnen op  bepaalde  zaken  hebt  gezet.  En  het  mooie  is  dat  het  ook  nog  vaak  goed  uitpakt.  Bedankt  voor  de  prettige  samenwerking  als  lab‐bench  buddy  en  de  gezellige  tripjes  die  we  hebben  gemaakt  naar  congressen in o.a. Berlijn en Bath. Op naar (hopelijk) Bacell 2020 in Japan! Ik wens je nog heel veel  succes en denk dat je met jouw instelling zeker ver zult komen.   

I also would like to give a special “thank you” to the people at Genencor‐DuPont, Cristina Bongiorni, 

Brian  Schmidt  and  Marc  Kolkman.  Thanks  for  your  trust  and  the  nice  collaboration  we  had.  This 

(6)

intramembrane  protease  RasP  in  protein  secretion.  I  hope  we  will  be  able  to  continue  this  collaboration in the future.  

Bij  deze  wil  ik  ook  graag  heel  hartelijk  dankzeggen  tegen  de  mannen  in  de  keuken  van  het  Bacteriologie‐lab.  Beste  Guido  en  Bert,  zonder  jullie  inzet  zou  het  werken  in  het  H1‐lab  een  stuk  gecompliceerder zijn. Bedankt voor het maken van de vele media en buffers en het schoonmaken van  ons glaswerk. Jullie worden zeer gewaardeerd! Op dezelfde manier wil ik ook onze vaste schoonmaker 

Mike  bedanken  voor  het  schoonhouden  van  de  kantoren  en  de  labruimte.  Beste  Mike,  heel  erg 

bedankt voor je inzet, en samenwerking. Zonder schoon kantoor of lab kunnen wij niet ons werk doen  zoals we dat nu doen. Hetzelfde geld voor een goed georganiseerd isotopenlab. Wouter en later Frank  heel erg bedankt voor jullie inzet om dit lab zo overzichtelijk en schoon mogelijk te houden. Dit heeft  zeker bijgedragen aan mijn resultaten. Ook Peter van het isotopenlab, wil ik heel hartelijk bedanken  voor je punctualiteit (mits goed opgewonden natuurlijk  ).  Natuurlijk wil ik ook de dames van het secretariaat niet vergeten te noemen. Ank, Judith, Eline en  Carolien, bedankt voor al jullie hulp als ik voor de zoveelste keer een pakketje naar het buitenland  moest sturen en de formulieren van FedEx nergens kon vinden (Wat fijn dat dit nu digitaal kan…). Ank  ook hartelijk bedankt voor je hulp met het versturen van mijn manuscript naar de leescommissie en  het verzenden van mijn daaruit resulterende boekjes.   Zonder mijn eerdere ervaringen op moleculaire labs had ik deze stap niet gezet. Hierbij wil ik dan ook  hartelijk dankzeggen tegen Rasmus Larsen (toen nog) van de vakgroep Moleculaire Genetica (RUG),  en Kees Leenhouts en Maarten van Roosmalen van (destijds) Biomade, die mij tijdens en na mijn stage  de eerste stappen hebben laten nemen in het moleculaire werk. We zijn elk ons weegs gegaan, maar  ik heb veel van jullie geleerd en gebruik veel van de “tips and tricks” nog steeds met veel plezier en  succes. Ook Jetta Bijlsma, bedankt voor de kans om bij jou te kunnen starten toen ik erachter kwam  dat ik graag verder wilde in de wetenschap. Ik hoop dat je bij MSD een mooie nieuwe uitdaging hebt  gevonden. Allen bedankt voor de prettige samenwerking.  Of course I also would like to thank all the (Ex‐)members of the MolBac group, which are a lot over the  last couple of years. A very special and warm “Thank you” for Vivianne. Thanks a lot for your help on  taking  care  of  the  pulse‐chase  labeling  experiments  when  it  turned  out  I  was  pregnant  (my  other  project). This resulted in the end in two chapters, where you had valuable input. I hope you have a  wonderful time at Imperial College in London, together with your family. Ik wil ook hierbij graag de  Bacillus‐boys Ruben en Ewoud danken voor het warme onthaal terug bij Molbac met een glas ‘left‐ over’ witte wijn ;‐). Heel erg bedankt voor jullie hulp bij het opstarten van het, voor mij toen nog minder  bekende, Bacillus werk. Bedankt voor alle waardevolle tips! Also many thanks to Emma for answering  all my questions about Bacillus‐stuff. Although some people in the lab do their utmost best (sorry, no  offence,  keep  trying),  your  cakes  and  especially  the  magical  macarons  are  still  being  missed….  Ook 

(7)

Rense en Dennis, de pensionado’s, dank voor alle samenwerking en geweldige discussies. Dennis, het 

was erg leuk om bij jouw promotie als paranimf te mogen optreden. Superknap dat je dat aan het  einde van je carrière nog hebt afgemaakt, al was dat soms wel even doorbijten. Rense, dank voor al je  interesse  en  gezelligheid,  en  het  beantwoorden  van  al  mijn  vragen  over  chemicaliën  (zaken  die  ik  eigenlijk zelf ook zou moeten weten, maar wat soms iets te ver was weggezakt). Min and Margarita,  thanks for being my lovely roomies of the nicest office in the lab. Of course also a special thanks to  Suruchi (it is almost your time to …!), Elias, Tim (for the nice chats about our kids and all the troubles  and pleasures they give us), Laura, Yanyan, Andrea, Stefano (for the help on Chapter 1), Marina (for  bringing the best Serrano‐hams to the lab!), Usma, Yaremit, Bimal (my first Bacillus student and now  PhD student in the Bacillus team. Well done, you are almost there!), Marjolein, Lisanne (for all the  creative input in our group. The “Gingi‐monster” is one of my kids favorites!), Mafalda, Xin (for the  exiting food‐tastings during lunch), Fransicso (for being co‐author and continuing the work on L. lactis  and the precious vector set), Jolien (I hope you have a great time in Greifswald, and I am sure you are  close to finishing off as well!), Francis, Elisa, Marines, Hermie, Sierd, Eleni (my fellow‐Molbac‐mom, it  was great being pregnant together and sharing our experiences over lunch (preferably at the Greek  restaurant). Thanks for your unstoppable enthusiasm. I am glad you found a nice working spot which  suits you perfectly! Lots of success!), Carien, Gaby, Paola, Giorgio (for the delicious chocolate salami),  Rita, Lu, Monica (the other Molbac‐mom, I am happy you are happy! I wish all the best for you and  Oskar), my Lactococcus student and co‐author Marindy and the Bacillus‐students Femmie, Simone,  Patrick and Robert for the nice collaborations we had. Thanks to you all for the nice atmosphere in the  lab and the wonderful times we had during the lab‐trips and the hilarious Sinterklaas/New Year/Old  Year/Mid‐winternight‐parties  (whatever  name  is  suitable)  with  the  big  fights  for  the  best  presents.  Sorry Tim, the tuinkabouter is still very special to me and my kids, we keep him. To all the people I  forgot to mention, also a Big Big Big THANK YOU for all your additions to the nice and fruitful working  atmosphere at H1! 

Zonder  ontspanning  geen  inspanning.  Hierbij  wil  ik  al  mijn/onze  vrienden  graag  danken  voor  alle  gezelligheid. Ruben en Ida, hartstikke fijn dat we onszelf altijd konden uitnodigen voor een ontspannen  weekendje in Amsterdam, of twee weekjes op Curaçao. We hebben ontzettend veel leuke en gezellige  dingen  gedaan  (vooral  dat  ontspannen  tripje  naar  de  top  van  de  Christoffelberg  ben  ik  nog  niet  vergeten, en jullie zullen het ook niet snel vergeten vrees ik (whahahaha)…). Ontzettend leuk dat jullie  weer in het Hoge Noorden zijn neergestreken. (Roden‐Peize (Zou daar een handtasjes‐museum zijn?)  is  toch  van  een  heel  andere  orde  dan  Emmen/Roden‐Amsterdam/Curaçao).  Gieta  en  Dennis  (ook  Biomade‐alumni), al zien we elkaar nu we beide kinderen hebben toch iets minder, de gezelligheid is  er zeker niet minder om wanneer we toch weer eens een gaatje vinden in de agenda. Tijd om weer 

(8)

eens een afspraak te maken! Brenda, bedankt voor jaren gezelligheid. Leuk dat we nu af en toe nog  eens kunnen gaan lunchen en dan vooral bijkletsen samen.  Als werkende moeder is het ontzettend belangrijk dat er goede opvang voor de kinderen is als je aan  het werk bent. Bij deze wil ik daarom ook mijn schoonouders Bert en Mannie hartelijk danken voor  elke ‘Maandag‐om‐de‐week’ die jullie in Roden bivakkeren om Joep en Nienke met veel liefde op te  vangen. Ik weet dat jullie het graag doen, maar een keer extra Dank‐je‐wel is geen overbodige luxe.  Ook toen we nog in Emmen woonden was het geen enkel probleem om Joep (en later ook onze toen  nog  baby‐Nienke)  bij  jullie  en  bij  mam  (en  pap  die  aan  het  werk  was)  in  Beilen  te  brengen.  Donderdagavond @Beilen was toch echt even een heerlijk rustmoment in de week. Allemaal hartelijk  dank  hiervoor!  Amber,  heel  erg  bedankt  voor  je  hulp  bij  het  ontwerpen  van  de  cover  van  mijn  proefschrift.  Het  was  een  beetje  een  uitdaging  omdat  we  beide  een  andere  versie  van  het  computerprogramma hadden, maar uiteindelijk is het dan toch gelukt. Samen met Marieke vind je het  altijd gezellig als Joep of Nienke een keer komt logeren. Niks is dan te gek en dit vinden ze alle twee  natuurlijk geweldig. We kunnen echt zien dat ze ervan genieten! Pim en Stephanie, bedankt voor de  gezellige spelletjes‐avonden, waarbij het hoogste doel is om Sander niet te laten winnen… ;‐) Het wordt  wel weer eens tijd voor een potje.  Mijn zussen, Selien en Martine (en natuurlijk de mannen, Richard en Robert), hartstikke bedankt dat  jullie er altijd zijn. Bedankt ook voor de gezellige weekendjes op Ameland (en ja, dit jaar is toch echt  de laatste keer….NOT!). Pap en mam, heel erg bedankt voor alle mogelijkheden die jullie me geboden  hebben om te kunnen doen wat ik graag wil. We zeggen het nooit tegen elkaar, maar ik weet dat jullie  altijd achter me hebben gestaan (ook al was het vaak lastig om te begrijpen wat ik nou eigenlijk doe).  Super bedankt voor alles! Ik hou van jullie!  Als laatste wil ik heel graag mijn allerliefsten, Sander, Joep en Nienke, bedanken. Sander, zonder jou  zou het leven een stuk saaier zijn. Bedankt voor je ondersteuning en gewoon voor wie je bent, ik hou  ontzettend veel van je. We hebben en gaan er nog iets leuks van maken samen! Joep en Nienke, ik heb  heel veel zin in alle avonturen die we nog samen gaan beleven. Blijf wie je bent en doe wat je wilt.  (‘Angst is mar veur eben, spiet is veur altied!’ (hier ga ik als jullie moeder nog spijt van krijgen…… ;‐) )  Dikke kus en knuffel voor jullie! LUVU! 

 

Allemaal bedankt, thanks to you all! 

Liefs,   Jolanda 

(9)

   

(10)

Curriculum Vitae (NL) 

Jolanda Neef is geboren op 14 augustus 1978 in het Groningse plaatsje Bedum. Op haar 9de is zij samen  met haar familie verhuisd naar Beilen, waar ze naar de middelbare school is gegaan. Na haar VHBO  opleiding, heeft ze in 2002 de Hogere Laboratorium opleiding (afstudeerrichting Biotechnologie) met  succes afgerond. Meteen na deze opleiding kon ze aan de slag bij het Groningse biotechnologiebedrijf  BioMade, waar ze 3 jaar met plezier heeft gewerkt aan het “Protein Anchor project” onder leiding van  Dr. Kees Leenhouts. Hier heeft ze een bijdrage geleverd aan de ontwikkeling van een mucosaal vaccin  tegen Streptococcus pneumoniae‐ en malaria‐infecties. Hierna is ze gaan werken bij de Moleculaire  Genetica groep van de Rijksuniversiteit Groningen. Onder leiding van Dr. Jetta Bijlsma heeft ze hier  onderzoek gedaan naar de mechanismen die Streptococcus pneumoniae gebruikt om de bloed‐hersen‐ barrière te passeren. In 2007 heeft ze de overstap gemaakt naar de Medische Microbiologie afdeling  van het UMCG, onderzoeksgroep Moleculaire Bacteriologie, onder leiding van Prof. Jan Maarten van  Dijl.  Hier  is  ze  eerst  betrokken  geweest  bij  een  studie  naar  de  rol  van  Mg‐transporters  bij  de  translocatie  van  S.  pneumoniae  door  endotheel  cellen.  Later  raakte  ze  betrokken  bij  het  TIPharma  project AntiStaph met als doel de ontwikkeling van een vaccin tegen Staphylococcus aureus. Voor haar  bijdrage aan dit project heeft ze de “Award for Technical Excellence 2010”, uitgereikt gekregen door  de Federatie Innovatief Geneesmiddelen Onderzoek Nederland (FIGON). Na een korte periode bij de  afdeling  Klinische  Virologie  van  het  UMCG  gewerkt  te  hebben,  is  ze  in  2012  begonnen  aan  een  promotietraject. Hierbij heeft ze nauw samen gewerkt met de firma Genencor‐DuPont ten behoeve  van het optimaliseren van eiwitsecretie in Bacillus subtilis. Dit heeft uiteindelijk geresulteerd in een  patent  op  basis  van  de  studie,  beschreven  in  hoofdstuk  6  van  dit  proefschrift.  Dit  proefschrift  is  gebaseerd  op  de  bevindingen  opgedaan  tijdens  het  TIPharma  project  en  de  samenwerking  met  Genencor‐DuPont.  

 

(11)

Curriculum Vitae (ENG) 

Jolanda Neef was born on the 14th of August 1978 in Bedum, the Netherlands. When she was 9 years  old, she moved with her family to Beilen where she finished her secondary education. In 2002 she  obtained her degree in Biotechnology from the Hanzehogeschool in Groningen. After completing her  professional education, she obtained a position in the biotechnology company BioMade, which was  situated in Groningen. Here she contributed to the “Protein Anchor Project” to develop protein‐based  vaccines against Streptococcus pneumonia and malaria infections under the supervision of Dr. Kees  Leenhouts. In 2005 she moved to the Molecular Genetics group of the University of Groningen. Here  she investigated under the supervision of Dr. Jetta Bijlsma the mechanisms employed by Streptococcus  pneumoniae to cross the blood‐brain‐barrier. Two years later she was able to join the department of  Medical Microbiology of the UMCG in Groningen. In the research‐group of Prof. Jan Maarten van Dijl  she started working as a Research Technician on a project to investigate the role of Mg transporters in  the translocation of S. pneumoniae across endothelial cell layers. Later on she became involved in the  TIPharma  project  AntiStaph,  which  was  aimed  at  developing  a  protein‐based  vaccine  against 

Staphylococcus aureus. For her contributions to this project, she received the “Award for Technical  Excellence 2010” by the Dutch Federation of Innovative Drug Research (FIGON). After a short period  in the Clinical Virology laboratory, she started in 2012 as a PhD fellow in the Molecular Bacteriology  group under direct supervision of Prof. Jan Maarten van Dijl. During this period she worked closely  together with the company Genencor‐DuPont to optimize protein secretion in Bacillus subtilis. This  resulted in a patent that is based on the data described in Chapter 6 of this thesis. Altogether, the  results  obtained  during  the  TIPharma  project  and  the  collaboration  with  Genencor‐Dupont  have  resulted in this thesis.  

(12)

List of Publications 

1. Neef J, van Dijl JM*, Buist G*, A Tale of Two Cell factories ‐ Heterologous protein secretion in 

Bacillus subtilis and Lactococcus lactis, Manuscript to be submitted (*equal contributions) 

2. Neef J, Bongiorni C, Schmidt B, Goosens VJ, van Dijl JM, Relative contributions of non‐essential 

Sec  pathway  components  and  cell  envelope‐associated  proteases  to  high‐level  enzyme  secretion by Bacillus subtilis, Manuscript to be submitted 

3.  Romero Pastrana F*, Neef J*, Koedijk DGAM, de Graaf D, Duipmans J, Jonkman MF, Engelmann  S,  van  Dijl  JM,  Buist  G,  Human  antibody  responses  against  non‐covalently  cell  wall‐bound 

Staphylococcus aureus proteins, Sci Rep, 2018, 8(1):3234. (*equal contributions) 

4.  Romero Pastrana F, Neef J, van Dijl JM, Buist G, A Lactococcus lactis expression vector set with  multiple  affinity  tags  to  facilitate  isolation  and  direct  labeling  of  heterologous  secreted  proteins, Appl Microbiol Biotechnol, 2017, 101(22):8139‐8149. 

5. Neef  J*,  Bongiorni  C*,  Goosens  VJ,  Schmidt  B,  van  Dijl  JM,  Intramembrane  protease  RasP 

boosts protein production in Bacillus, Microb Cell Fact, 2017, 16(1):57. (*equal contributions)  6.  Neef J, Milder FJ, Koedijk DG, Klaassens M, Heezius EC, van Strijp JA, Otto A, Becher D, van Dijl 

JM,  Buist  G,  Versatile  vector  suite  for  the  extracytoplasmic  production  and  purification  of  heterologous  His‐tagged  proteins  in  Lactococcus  lactis,  Appl  Microbiol  Biotechnol,  2015,  99(21):9037‐48. 

7.  van den Berg S, Koedijk DG, Back JW, Neef J, Dreisbach A, van Dijl JM, Bakker‐Woudenberg IA,  Buist  G,  Active  immunization  with  an  octa‐valent  Staphylococcus  aureus  antigen  mixture  in  models of S. aureus bacteremia and skin infection in mice, PLoS One, 2015, 10(2):e0116847.  8.  Glasner C, van Timmeren MM, Stobernack T, Omansen TF, Raangs EC, Rossen JW, de Goffau 

MC, Arends JP, Kampinga GA, Koedijk DG, Neef J, Buist G, Tavakol M, van Wamel WJ, Rutgers  A, Stegeman CA, Kallenberg CG, Heeringa P, van Dijl JM, Low anti‐staphylococcal IgG responses  in  granulomatosis  with  polyangiitis  patients  despite  long‐term  Staphylococcus  aureus  exposure, Sci Rep, 2015, 5:8188. 

9.  Krishnappa  K,  Monteferrante  CG,  Neef  J,  Dreisbach  A,  van  Dijl  JM,  Degradation  of  extracytoplasmic catalysts for protein folding in Bacillus subtilis, Appl Environ Microbiol, 2014,  80(4): 1463‐8. 

10. Neef  J,  Koedijk  DG,  Bosma  T,  van  Dijl  JM,  Buist  G,  Efficient  production  of  secreted 

staphylococcal antigens in a non‐lysing and proteolytically reduced Lactococcus lactis strain,  Appl Microbiol Biotechnol, 2014, 98(24):10131‐41. 

(13)

11.  Carvalho SM, Farshchi Andisi V, Gradstedt H, Neef J, Kuipers OP, Neves AR, Bijlsma JJ Pyruvate  oxidase  influences  the  sugar  utilization  pattern  and  capsule  production  in  Streptococcus 

pneumonia, PLoS One, 2013 Jul 3;8(7):e68277. 

12.  Neef J, Andisi VF, Kim KS, Kuipers OP, Bijlsma JJ, Deletion of a cation transporter promotes lysis  in Streptococcus pneumoniae, Infect Imm, 2011,79(6):2314‐23. 

13.  Audouy S, van Selm S, van Roosmalen ML, Post E, Kanninga R, Neef J, Estevão S, Nieuwenhuis  EE,  Adrian  PV,  Leenhouts  K,  Hermans  PW,  Development  of  lactococcal  GEM‐based  pneumococcal vaccines, Vaccine, 2007, 25(13):2497‐506. 

14.  Audouy S, van Roosmalen ML, Neef J, Kanninga R, Post E, van Deemter M, Metselaar H, van  Selm S, Robillard GT, Leenhouts KJ, Hermans PW, Lactococcus lactis GEM particles displaying  pneumococcal  antigens  induce  local  and  systemic  immune  responses  following  intranasal  immunization, Vaccine, 2006, 24(26):5434‐41. 

15.  van Roosmalen ML, Kanninga R, El Khattabi M, Neef J, Audouy S, Bosma T, Kuipers A, Post E,  Steen  A,  Kok  J,  Buist  G,  Kuipers  OP,  Robillard  G,  Leenhouts  K,  Mucosal  vaccine  delivery  of  antigens tightly bound to an adjuvant particle made from food grade bacteria, Methods, 2006,  38(2):144‐9. 

16.  Bosma T, Kanninga R, Neef J, Audouy SA, van Roosmalen ML, Steen A, Buist G, Kok J, Kuipers  OP,  Robillard  G,  Leenhouts  K,  Novel  surface  display  system  for  proteins  on  non‐genetically  modified Gram‐positive bacteria, Appl Environ Microbiol, 2006 Jan 72(1):880‐9. 

 

Patent 

1.  Bongiorni  C,  Neef  J,  Schmid,  B  F,  van  Kimmenade  A,  van  Dijl  JM,  (2017)  Enhanced  protein  production and methods thereof. Patent No. WO/2017/112733. 

Referenties

GERELATEERDE DOCUMENTEN

with  Pro‐Q®  Diamond  Phosphoprotein  Gel  Stain  (Life  Technologies).  Cytosolic  cell  fractions 

The Gram‐positive bacterium Lactococcus lactis is known to be a suitable host for the expression and  secretion  of  heterologous  proteins  (Pontes  et  al. 

Healthy immune‐competent individuals display differing antibody responses to a vast array of S. aureus 

type (wt) or ΔtepA mutant control cells expressing AmyE, AmyL or BPN’ were grown for 16 hours in MBU medium.  Next,  cells  and  growth  media  were 

In contrast to the non‐producing cells, some differences in HtrA or HtrB production were observed in  amylase‐producing  mutants  that  lack  particular 

upon  RasP  overexpression  may  contribute  to  the  improved  production  of  Properase  and 

geduwd  en  op  die  manier  komt  het  aan  de  buitenkant  van  de  cel  terecht  in  de  ruimte  tussen  de  membraan  en  de  celwand.  Hier  zijn  nog 

To thrive and survive in different ecological niches, bacteria secrete a wide range of different proteins.  This  allows  them  to  take  optimal  advantage