Belangrijke punten Biochemische en Fysische Processen (5B102) Maarten van der Doelen 2008-2009

Belangrijke punten Biochemische en Fysische Processen (5B102)

Maarten van der Doelen 2008-2009

pH = -log [H⁺] pKa = -log Ka

Bijvoorbeeld: CH3COOH ↔ CH3OO^- + H⁺ Ka =^{ሾେୌଷେ୓୓}_{ሾେୌଷେ୓୓ୌሿ}^{షሿሾୌశሿ}= 1,75 ∙ 10^ିହ pKa = -log Ka = 4,8

20 aminozuren

- Glycine is niet optisch actief - Proline is een iminozuur

Henderson-Hasselbach vergelijking: pH = pKa + log_ሾୌ୅ሿ^ሾ୅షሿ Isoelektrisch punt: ^{୮୏ୟభ ା ୮୏ୟమ}

ଶ

Verhouding berekenen bij bepaalde pH dmv. pKa: 10^{^(೛ಹష೛಼ೌ)} Enzymen:

- Versnellen een reactie - Worden zelf niet gebruikt - Beïnvloeden het evenwicht niet - Zijn eiwitten

- Verlagen activatie-energie

- Afhankelijk van pH, Temperatuur, Substraat

- 6 hoofdklassen van enzymen (Zie Tabel 5.2 Baynes 2^ND Edition)

Isoenzymen:

- Zelfde reactie - Ander enzym

- Verschillende Km of Vmax

Enzymkinetiek:

Michaelis-Menten: v =^{୚୫ୟ୶ ∙ሾୱሿ}_{୏୫ାሾୱሿ}

Enzym-remming:

- Competitief:

- Oncompetitief:

- Non-competitief:

Turnover Number: hoeveel mol substraat er per mol enzym per minuut omgezet wordt

= mol substraat/mol enzym/min.

Koolhydraten:

- Hoe meer C-atomen geoxideerd zijn, hoe minder energie ze bevatten - Vetten bevatten meer energie dan Carbohydraten (suikers)

- ATP = energiedrager

- Fad en NAD⁺ zijn elektronentransporteurs

Afbraak Glucose: aeroob

C6H12O6 + 2 NAD⁺ + 2 ADP → 2 Pyruvaat + 2 NADH + 2 ATP

Afbraak Glucose: anaeroob

C6H12O6 + 2 NAD⁺ + 2 ADP → 2 Lactaat + 2 ATP

Glycogenese = opslag glucose als glycogeen Glycogenolyse = afbraak van glycogeen tot glucose Gluconeogenese = nieuwvorming van glucose Glycolyse = afbraak van glucose

Biogenetica

G = Vrije energie (voor arbeid) A + B ↔ C + D

∆ G = (GC + GD) – (GA + GB)

∆ G > 0 Reactie naar links

∆ G < 0 Reactie naar rechts

∆ G = 0 Evenwicht

Evenwicht: K =_{ሾ୅ሿሾ୆ሿ}^{ሾେሿሾୈሿ}

∆ Gº = Standaard vrije energie

∆ Gº = - R · T · ln K R = Gasconstante (8,31) T = Absolute temperatuur (K)

∆ Gº = ∆ Gº bij pH 7

∆ Gº = ∆ G bij [A] = [B] = [C] = [D] = 1M

∆ Gº < 0 Evenwicht rechts

∆ Gº . 0 Evenwicht links

G =
Gº + R · T · ln _{ሾۯሿሾ۰ሿ}^{ሾ۱ሿሾ۲ሿ}

Glycolyse

In erytrocyten: Glucose → Lactaat In overige celen: Glucose → Pyruvaat

C6H12O6 + 2 NAD⁺ + 2 ADP + 2 Pi → 2 C3H6O3 + 2 NADH + 2 ATP 3 delen:

1. Splitting stage 2. Investment stage 3. Yield stage

- 2,3-Bifosforglyceraat bepaalt affiniteit van O2 aan Hb.

- Fosfokinase-1 is belangrijkste regulerende enzym van de glycolyse - Glycogenese/Glycogenolyse: blz 159 Baynes (2^ND Edition)

- Glyconeogenese: blz. 169 Baynes (2^ND Edition)

Citroenzuurcyclus

Pyruvaat + CoA + NAD⁺ ௉.஽௘௛௬ௗ௥௢௚௘௡௔௦௘ (௘௡௭௬௠)

ሱۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛۛሮ Acetyl-CoA + CO2 + NADH Acetyl-CoA + Oxaloacetaat → Citraat

Volledige citroenzuurcyclus: z.o.z.

Netto opbrengst: 3 NADH, 1 GTP, 1 FADH2, 2 CO2

Citroenzuurcyclus

Oxidatieve Fosforylering

Netto opbrengst Citroenzuurcyclus: 3 NADH, 1 GTP, 1 FADH2, 2 CO2

3 NADH → 9 ATP 1 FADH2 → 2 ATP

Netto Oxidatieve Fosforylering:

ADP + Pi + ½ O2 + 2 H⁺ → ATP + H2O

Drietal pompen op binnenste membraan van mitochondrium:

- Protonpomp I - Protonpomp III - Protonpomp IV

Voeding

Eiwitten → Aminozuren

Koolhydraten → Mono-, Di- en polysaccharides Vetten → Vetzuren, glycerol + vetzuren

Essentiële vetzuren: ω-3 en ω-6

Vitaminen:

- A,D,E,K in vet oplosbaar - 13 vitaminen

BMR:

- Vrouw en man verschillend

RQ = ^େ୓మି ୳୧୲ୱୡ୦ୣ୧ୢ୧୬୥ (୫୪/୫୧୬.)

୓మି ୭୮୬ୟ୫ୣ (୫୪/୫୧୬.)

Nucleotiden

Nucleotiden:

- Stikstofhoudende base - 5 C-atomen suiker - Fosfaatgroep

Nucleosiden:

- Stikstofhoudende base - 5 C-atomen suiker

Panel 2-6, pagina 76-77 Alberts (2^ND Edition)

Membranen

ATP ^{௘௡௭௬௠}ሱۛۛۛሮ cAMP + PPi V = 62 · ¹⁰log ൫^{௢௨௧௦௜ௗ௘}_{௜௡௦௜ௗ௘}൯

Stroming

O1 O2 O3

P1 P2 P3

v1 v2 v3

ɸ1 ɸ2 ɸ3

Geen wrijving:

ɸ1 = ɸ2 = ɸ3

O1 > O

P1 > P2

v1 < v2

P1 + ½ ·P1 · v1

2 = P2 + ½ ·P2 · v2 2 Druk lager → Snelheid groter P2 – P1 = p · g · (h1 –h2)

Wel wrijving:

ɸ = O · ࢜ഥ ɸ = ^∆ࡼ

ࡾ

R = ^{ૡ · ࣁ · ࡸ}

࣊ · ࢻ^૝

* (polaire kop):

- Serine - Choline - Ethanolamine

Elasticiteit

E = Elasticiteitmodulus (Pa)

T = P · R

T = Wandspanning R = Straal

Geluid

Geluidsniveau = 10 · ¹⁰log ^୍

ଵ଴^షభమ (Db)

Geluidsintensiteit = ^୔

ସ · ஠ · ୰^మ (Watt/ m²)

Verschil in geluidsniveau = 10 · ¹⁰log ^୍భ

୍_మ (Db)

Geluidsniveau’s mag je niet optellen, intensiteiten wel!

10 · ¹⁰log (begin) + 10 · ¹⁰log ^{୍ౘ౛ౝ౟౤}

୍బ

© Maarten van der Doelen 2008-2009

Aan deze samenvatting kunnen geen rechten worden ontleend.

F

O= E · ∆l l