University of Groningen
Mechanistic and translational studies to improve cisplatin sensitivity of testicular cancer
de Vries, Gerda
DOI:
10.33612/diss.135496604
IMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF) if you wish to cite from it. Please check the document version below.
Document Version
Publisher's PDF, also known as Version of record
Publication date: 2020
Link to publication in University of Groningen/UMCG research database
Citation for published version (APA):
de Vries, G. (2020). Mechanistic and translational studies to improve cisplatin sensitivity of testicular cancer. https://doi.org/10.33612/diss.135496604
Copyright
Other than for strictly personal use, it is not permitted to download or to forward/distribute the text or part of it without the consent of the author(s) and/or copyright holder(s), unless the work is under an open content license (like Creative Commons).
Take-down policy
If you believe that this document breaches copyright please contact us providing details, and we will remove access to the work immediately and investigate your claim.
Downloaded from the University of Groningen/UMCG research database (Pure): http://www.rug.nl/research/portal. For technical reasons the number of authors shown on this cover page is limited to 10 maximum.
199
APPENDICES
About the author
List of publications
Dankwoord
(Acknowledgements)
201
ABOUT THE AUTHOR
Gerda de Vries werd geboren op 13 augustus 1989 in Leeuwarden. Na afronding van het VWO aan het Piter Jelles Aldlân in Leeuwarden, startte zij in 2007 met de opleiding Biologie aan de Rijksuniversiteit Groningen. Als hoofdrichting koos ze voor de major Biomedische wetenschappen. De vrije ruimte werd ingevuld met de minor Psychology in Society.
In 2010 startte Gerda met de masteropleiding Biomedical sciences in Groningen. Als onderdeel hiervan werd het tweede masterproject uitgevoerd aan het Walter and Eliza Hall Institute in Melbourne, Australië, onder leiding van Prof. dr. Paul G. Ekert. Hier onderzocht zij verschillende eiwitten en signaleringsroutes die de connectie vormen tussen IL-3 gemedieerde celoverleving en geprogrammeerde celdood in acute myeloïde leukemie.
In 2012 begon Gerda aan een tweede masteropleiding Forensic Science aan de Universiteit van Amsterdam. Het masteronderzoek werd uitgevoerd aan het Nederlands Forensisch Instituut in Den Haag bij de afdeling research humane biologische sporen. Hier werkte zij aan de ontwikkeling van een mitochondriële DNA screening tool die compatibel is met gedegradeerde samples. Eind 2014 begon zij met haar promotieonderzoek bij de afdeling Medische Oncologie van het UMCG onder leiding van Prof. dr. Steven de Jong. De resultaten van dit onderzoek staan beschreven in dit proefschrift. Momenteel is Gerda werkzaam als QA officer bij Ardena.
203
LIST OF PUBLICATIONS
Rosas-Plaza X, de Vries G, Meersma GJ, Suurmeijer AJH, Gietema JA, van Vugt MAT. et al. Dual mTORC1/2 inhibition sensitizes testicular cancer models to cisplatin treatment. Mol Cancer Ther 2020; 19: 590–601.
de Vries G, Rosas-Plaza X, van Vugt MATM, Gietema JA, de Jong S. Testicular cancer: determinants of cisplatin sensitivity and novel therapeutic opportunities. Cancer Treat Rev 2020; 88: 102054.
Weiler NEC, de Vries G, Sijen T. Development of a control region-based mtDNA SNaPshotTM
selection tool, integrated into a mini amplicon sequencing method. Sci Justice 2016; 56: 96–103. List of publications
205
DANKWOORD (ACKNOWLEDGEMENTS)
Wat eerst oneindig ver weg leek is dan toch aangebroken, het einde van mijn PhD en daarbij dit proefschrift! Natuurlijk heb ik de afgelopen jaren de nodige hulp en steun ontvangen. Hiervoor wil ik iedereen enorm bedanken.
Allereerst wil ik graag mijn promotores bedanken, prof. dr. S. de Jong, prof. dr. M.A.T.M. van Vugt en prof. dr. J.A. Gietema.
Beste Steven, jou passie en gedrevenheid voor de wetenschap zijn bewonderenswaardig. Waar ik de resultaten nog wel eens als vanzelfsprekend zag, liet jij me inzien dat ik soms best wat trotser op mijn resultaten mag zijn. Je toegankelijkheid heb ik als zeer positief ervaren, altijd stond je deur open en ook altijd was je geïnteresseerd in de uitkomsten van de lopende experimenten. Naast werk gerelateerde onderwerpen was er op onze wekelijkse meetings vaak ook ruimte voor een kletspraatje en een grapje. Mede hierdoor had ik me geen betere begeleider kunnen wensen.
Beste Marcel, altijd fijn wanneer je bij de wekelijkse meetings aanschoof en jou kritische blik op de resultaten worp. Ik weet zeker dat we hierdoor menig paper naar een hoger plan hebben kunnen tillen. Ook zijn er een aantal figuren in dit boekje te vinden die er, mede door jou hulp, erg gelikt uitzien al zeg ik het zelf.
Beste Jourik, zonder jou was hoofdstuk 5 nooit van de grond gekomen. Zelfs midden in de nacht stond je voor ons klaar om weefsel te ontvangen en voor te bereiden voor de PDX implantatie. Daarnaast was jou klinische blik zeker van toegevoegde waarde voor dit translationele onderzoek.
Thank you prof. dr. A. Samali, prof. dr. J.J. Schuringa and prof. dr. W. Helfrich for being part of my assessment committee.
Prof. dr. Albert Suurmeijer, uw kennis en inzicht in de pathologie van de zaadbalkanker waren essentieel voor het PDX stuk. Regelmatig heb ik bij u op kantoor gezeten om samen naar de histologie van het PDX weefsel te kijken, heel erg bedankt hiervoor.
Voor de analyse van de exome sequencing data heb ik veel hulp gehad van dr. Klaas Kok. Bedankt voor de tijd en uitleg van de data analyse als ook de interpretatie van de data. De samenwerking is mij erg goed bevallen met als eindresultaat een belangrijke bijdrage aan een mooie paper.
Erna van Sinttruijen, bedankt voor je hulp met Nexus Copy Number en jou uitleg over de interpretatie en analyse van SNP arrays.
Vincent Leeuwenburgh, je was niet alleen mijn roomie voor een tijdje, maar ook onmisbaar voor de RNA-seq data analyse. Het was leuk om met jou op kantoor te zitten en om samen de data te kunnen bespreken onder het genot van een bakje senseo.
206
Heel veel dank gaat uit naar Gert Jan en Phuong. Jullie hebben zoveel voor mij gedaan door de jaren heen. Vele MTT’s assays en BH3 profielen komen van jullie hand. Ook voor de verwerking van het PDX weefsel, inbedden, coupes snijden en IHC kleuringen kon ik altijd bij jullie terecht. Met jullie beide heb ik erg fijn samengewerkt en mooie gesprekken gevoerd.
Dear Ximena, my friend! I am really happy we got to work together on the testicular cancer project. I couldn’t have wished for a better partner. Work-wise we were a perfect team. But besides that, you are a true friend. Every day with you was fun, we laughed and made jokes so many times. Also for some serious complaining or support we could rely on each other. One day I hope to come visit you in Mexico city, I miss you man!
Lieve Margot, wat heb ik toch een mazzel gehad met jou als kantoorgenootje. Wij konden het gelijk goed met elkaar vinden, en nog steeds! We hebben lief en leed gedeeld, en ik ben dan ook heel erg blij dat jij mijn paranimf wilt zijn.
De fijne kneepjes van het PDX werk heb ik mogen leren van Tushar, Neeltje en Jolanda. Ook hebben Joost, Shang en Ilse mij heel vaak geholpen met het implanteren of meten van de muizen. Enorm bedankt voor jullie tijd.
Ik heb het geluk gehad om twee slimme studenten te mogen begeleiden tijdens hun master of afstudeerstage, Martijn en Anne. Bedankt voor alle leuke en gezellige lab- en koffie momentjes. Jullie data heeft zeker bijgedragen aan de totstandkoming van dit proefschrift.
Hetty en Coby, de labmanagers van het MOL lab. Bedankt dat ik altijd bij jullie terecht kon met mijn vragen, als ook voor jullie interesse in mijn project. Jullie kennis van zaadbalkanker kwam af en toe erg goed van pas.
Members of the ‘Bea, Marco and Steven’ group, I would like to thank you for all your questions and input during our Tuesday morning meetings.
Vele uren heb ik doorgebracht in het CDP. Daarom zou ik graag de medewerkers van het CDP willen bedanken voor alle goed hulp die ik daar heb gekregen. Heel erg fijn om te weten dat mijn muisjes altijd in goede handen waren.
To my coffee friends; Margot, Jolanda, Elles and Ximena, thanks for our regular ‘short’ coffee breaks. With you I’ve spent (too) many ‘gezellige’ hours in the coffee room. Sometimes, these breaks were all I needed.
Gert Jan, Margot en Linda P., altijd weer een feest om een visje, loempiaatje of FLFL’tje met jullie te halen. Ik ga onze gezellige lunches nog missen.
207
Tegen mijn roomies Arjan, Martin, Margot, Linda, Vincent en Ellen wil ik graag zeggen dat ik het heel erg naar m’n zin heb gehad met jullie op kantoor. Altijd, en misschien net iets te vaak, was er tijd voor geklets, koffie en leuke filmpjes. Dat laatste met name te danken aan Arjan en Martin. Daarnaast hebben we vele roomie dinners georganiseerd, spelletjes gespeeld en zijn we gaan waterskiën en boulen. Dankzij jullie was het nooit saai op kantoor.
Aan al mijn collega’s van het d zijn en elkaar regelmatig opzoeken. Ook onze jaarlijkse wielerweekendjes zijn altijd een groot succes en ik hoop dat we dat nog jaren vol zullen houden.
Leave Meinou, Elske en Sietske, jim kin ik al sûnt de basisskoalle en ik bin bliid dat we nei al die jierren noch altyd goeie freonen binne. It is altyd sa leuk om mei jim of te praten en wer even de lêste roddels fan thús thús troch te nimmen of lykas de ôfrûne tiid, online mei jim kofje te drinken.
Lieve Wendy, Fleur en Prathima, mijn Forensics vriendinnen. Na de studie zijn we gewoon doorgegaan met ons speurwerk en inmiddels hebben we al menig escape room opgelost. Zo gezellig dat we nu met drie van de vier in het hoge noorden wonen! Dat we nog maar vaak mogen escapen, maar ook sinterklazen, lekker eten of spelletjes spelen.
Leave Jolanda, wa hie tocht dat de biology les fan mr. de Roest sa’n ympakt op ús libben ha soe. Ek nei de middelbere skoalle ha we in soad tegearre meimakke: stúdzje biology, hûsgenoaten, Bernlef, op staazje nei Melbourne en beide in PhD by de medyske onkology. Ik bin bliid dasto myn paranimf wêze wolst!
En fansels myn famylje en skoanfamylje. Leave heit en mem, tige tank foar al jim help en stipe troch de jierren hinne en dat ik altyd by jim terjochte kin. Ik bin sa wiis mei jimme! Wendy en Robert, yn myn studintetiid fûn ik by jim in twadde thús, wat ha ik in soad by jim sliept. En no bin ik grutske tante fan Marijn en Silke. Anja en Jort, de itentsjes en (sport)aktiviteiten bin altyd wer feest. Ús reis nei Nij Seelan ferline jier sil ik nea ferjitte! Halbe, Davita en Gerrit, mei jim kin ik altyd leuk even swetse, dat hâlde we sa. Myn skoanfamylje: Jelle, Femmie, Meine, Thomaske, Elsa, Lars, Jelmer, Berber, Bart en Marjan, ik hie it net better treffe kinnen mei jim.
Lieve Jurjen, natuurlijk wil ik ook vooral jou bedanken voor al je steun de afgelopen jaren. Vaak genoeg kwam ik geïrriteerd thuis, maar altijd weet jij me weer op te vrolijken. Wat we ook met z’n tweeën ondernemen, wandelen, fietsen, ijsje halen, reizen, shoppen of zelfs huishouden, samen is het altijd leuker. Ik ben zo blij met jou! En oh ja, waar zou ik toch zijn zonder jou excel skills…
