Genomic and proteomic analysis in uveal melanoma Zuidervaart, W.

Citation

Zuidervaart, W. (2005, May 25). Genomic and proteomic analysis in uveal melanoma. Retrieved from https://hdl.handle.net/1887/2696

Version: Corrected Publisher’s Version

License: Licence agreement concerning inclusion of doctoral thesis in the_{Institutional Repository of the University of Leiden} Downloaded from: https://hdl.handle.net/1887/2696

GENOMIC AND PROTEOMIC ANALYSIS IN UVEAL MELANOMA

Proefschrift ter verkrijging van

de graad van Doctor aan de Universiteit Leiden, op gezag van de Rector Magnificus Dr.D.D.Breimer,

hoogleraar in de faculteit der Wiskunde en Natuurwetenschappen en die der Geneeskunde, volgens besluit van het College voor Promoties

te verdedigen op woensdag 25 mei 2005 klokke 14.15 uur

door

Wieke Zuidervaart geboren te Delft

Copromotores: Dr. N.A. Gruis Dr. M.J. Jager

Referent: Prof. Dr. W.J.Mooi (Vrije Universiteit Amsterdam) Overige leden: Prof. Dr. C.J. Cornelisse

Prof. Dr. R.R. Frants Prof. Dr. R. Willemze

This thesis was supported by the Landelijke Stichting voor Blinden en Slechtzienden, Rotterdamse Vereniging Blindenbelangen and Netherlands Organisation for Scientific Research (NWO).

“Het onbeschreven denken dat voorafgaat aan het denkbeeld en het overleeft, dat steeds maar net geboren is, en ongerijmder dan de zinnen die je vindt”

(Uit: ‘Begin is nooit begin’ van W.J. Otten)

P

I

G

: G

Chapter 2 Mutation analysis of the PTEN gene in uveal melanoma cell lines 25 Chapter 3 Activation of the MAPK pathway is a common event in uveal 35

melanomas although rarely occurs through mutation of BRAF or RAS

P

II

G

: G

Chapter 4 Expression profiling reveals that methylation of TIMP3 is involved 51 in uveal melanoma development

Chapter 5 Gene expression profiling identifies tumour markers potentially 69 playing a role in uveal melanoma development

Chapter 6 Increased PAK1 expression is associated with invasive potential in 83 uveal melanoma

Chapter 7 Activation of the Wnt signalling pathway and its downstream 103 effectors β-catenin and MMP7 in uveal melanoma is associated

with increased invasiveness and poorer survival

P

III P

Chapter 8 Proteomic analysis of uveal melanoma reveals novel potential 123 markers involved in tumor progression

Chapter 9 General discussion and future perspectives 141

Summary &&& Samenvatting & 153

Color illustrations 161

List of publications 166