• No results found

Chemical tools for the study of proteolytic activities associated with antigen presentation

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Share "Chemical tools for the study of proteolytic activities associated with antigen presentation"

Copied!
2
0
0

Bezig met laden.... (Bekijk nu de volledige tekst)

Hele tekst

(1)

Chemical tools for the study of proteolytic activities associated with

antigen presentation

Swieten, Paul Franciscus van

Citation

Swieten, P. F. van. (2007, January 18). Chemical tools for the study of proteolytic activities associated with antigen presentation. Retrieved from https://hdl.handle.net/1887/9143

Version: Corrected Publisher’s Version

License: Licence agreement concerning inclusion of doctoral thesis in the Institutional Repository of the University of Leiden

Downloaded from: https://hdl.handle.net/1887/9143

Note: To cite this publication please use the final published version (if applicable).

(2)

Stellingen

behorende bij het proefschrift

Chemical Tools For The Study Of Proteolytic Activities

Associated With Antigen Presentation

1. De combinatie van de ICAT strategie met ‘activity based probes’ opent het nieuwe onderzoeksveld van quantitatieve functionele proteomics.

Hoofdstuk 4 van dit proefschrift

S. P. Gygi, B. Rist, S. A. Gerber, F. Turecek, M. H. Gelb and R. Aebersold, Nature Biotechnol., 1999, 17, 994-997.

D. Greenbaum, K. F. Medzihradszky, A. Burlingame and M. Bogyo, Chem. Biol., 2000, 7, 569-581.

2. De ongewenste scheiding op HPLC van isotopomeren is niet de grootste uitdaging in het veld van de quantitatieve functionele proteomics.

Hoofdstuk 4 van dit proefschrift

R. Xhang, C. S. Sioma, S. Wang and F. E. Regnier, Anal. Chem., 2001, 73, 5142-5149.

3. Naast een tweetrapsstrategie biedt ook een celpenetrerende peptidesequentie de mogelijkheid enzymatische activiteiten in levende cellen met biotine te labelen.

Hoofdstuk 2 en 6 van dit proefschrift

A. E. Speers, G. C. Adam and B. F. Cravatt, J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 4686-4687.

4. Bij de NMR-analyse van isotoop gelabelde verbindingen dient men rekening te houden met signalen van grote multipliciteit.

Hoofdstuk 4 van dit proefschrift

5. Saghatelian et al. rekken de omschrijving van een 'activity based probe' op zodat ook hun ‘affinity based probe’ binnen die omschrijving valt.

A. Saghatelian, N. Jessani, A. Joseph, M. Humphrey en B. F. Cravatt, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, 101, 10000-10005.

6. Merkx et al. publiceren een nieuwe chemoselectieve ligatie, zonder te vermelden welke functionele groepen deze ligatie tolereert.

R. Merkx. A. J. Brouwer, D. T. S. Rijkers en R. M. J. Liskamp, Org. Lett., 2005, 7, 1125-1128.

7. Een reactiemechanisme waarbij een triazool gealkyleerd wordt met een aryl of vinyl halide, kan niet uitgesloten worden in de een-pots synthese van gesubstitueerde triazolen van Feldman et al.

A. K. Feldman, B. Colasson en V. K. Fokin, Org. Lett., 2004, 6, 3897-3899.

8. Alleen door het gebruik van antibiotica terug te dringen kan de selectiedruk op resistentie van bacteria afnemen.

9. Het is verontrustend hoeveel organisch chemici niet op de hoogte zijn van de structuur van P4O10. 10. Alvorens een beleid wordt ingevoerd dat verstandelijk gehandicapten ontmoedigt kinderen te

krijgen, dient eerst een eenduidig verband tussen verstandelijke vermogens en verantwoord ouderschap aangetoond te worden.

J. N. de Vries, D. L. Willems, J. Isarin en J. S. Reinders, Samenspel van factoren, Amsterdam 2005.

Ouderschap bij mensen met een verstandelijke handicap schiet vaak tekort, persbericht van het Ministerie van Volksgezondheid, Welzijn en Sport, 19 mei 2005.

Referenties

GERELATEERDE DOCUMENTEN

N -methylmethanaminium hexa- fluorophosphate HCTU N -[(1H-6-Chlorobenzotriazolo-1- yl)(dimethylamino)methylene]- N - methylmethanaminium hexafluorphosphate N -oxide HIV

Chapter 3 describes the application of this two-step labeling strategy in the identification of a peptide vinyl sulfone based inhibitor that specifically inhibits one of the

succeeded in introducing amino acids with unsaturated side chains (for instance, 2-amino-5-hexynoic acid) into proteins. 12 In a joint effort of the Tirrell and Bertozzi groups,

irreversible proteasome inhibition and subsequent Staudinger ligation- mediated biotinylation to enable visualization of proteasomes in an activity- based manner.

Activity probe 5 allows two step labeling of active caspase-like subunits of the immunoproteasome and, at higher concentrations, of the constitutive proteasome.. Labeled subunits

10, 11 A relevant example of a chemical proteomics probe is represented by 1a (DCG-04, Figure 1), developed by Bogyo and coworkers as an irreversible cysteine protease inhibitor,

As a model for the dialysis of 1, ovalbumin was incubated with DCG-04 (compound 1a, Chapter 4) under the same conditions as 1. Unexpectedly, not only cathepsin labeling was found

Fusion of an activity based cysteine protease probe to the nonaarginine cell penetrating peptide would yield a probe that enters the cell in the fashion dictated by the