Automated analysis and visualization of preclinical whole- body microCT data
Baiker, M.
Citation
Baiker, M. (2011, November 17). Automated analysis and visualization of preclinical whole-body microCT data. Retrieved from
https://hdl.handle.net/1887/18101
Version: Corrected Publisher’s Version
License: Licence agreement concerning inclusion of doctoral thesis in the Institutional Repository of the University of Leiden
Downloaded from: https://hdl.handle.net/1887/18101
Note: To cite this publication please use the final published version (if applicable).
Robust skeleton registration should employ a hierarchical anatomical model that contains the most proximal bones at the highest level and the most distal bones at the lowest level. (this thesis)
Registration of follow-up data from studies on the progression of osteoly- sis should include a priori knowledge of the bone shapes, because mor- phological changes over time are often substantial. (this thesis)
The combination of intensity information and skeletal correspondence in the registration criterion enables robust and accurate whole-body regis- tration in follow-up MicroCT data. (this thesis)
A good strategy for whole-body registration is to register all high-contrast structures and interpolate the low-contrast structures, using anatomical animal models. (this thesis)
Robust registration of articulated structures requires integration of a priori knowledge of realistic motion constraints of the joints.
Side-by-side visualization of corresponding structures in follow-up data- sets greatly facilitates data navigation, understanding and quantification.
By adding shape penalties to the optimization criterion it is possible to deal with large shape differences between a source and a target object.
An extensive evaluation of a new method for medical image analysis and in-depth statistical analysis of the results should be a prerequisite for publication in any serious journal.
Did I request thee, Maker, from my clay to mould me Man? Did I solicit thee from darkness to promote me?
Adam to God in John Milton's ‘Paradise Lost’
Governmental aid has been, and continues to be, an unmitigated political, economic, and humanitarian disaster for most parts of the developing world. In short it is (as Karl Kraus said of Freudianism), the disease of which it pretends to be the cure.
Dambisa Moyo in ‘Dead Aid’
The world would be a more peaceful place, if people would focus more on what unites them and less on what separates them.
Personal freedom ends, where other peoples freedom is violated.
d
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
Propositions
Om een bottenstelsel robuust te registreren is een hiërarchisch anatomisch model nodig dat op het hoogste aggregatieniveau de meest proximale en op het laagst niveau de meest distale botten bevat. (dit proefschrift)
Omdat de morfologische verschillen tussen dezelfde botten in longitudinale studies vaak erg groot zijn, zou een registratiemethode gebruik moeten maken van a priori informatie van de botvormen. (dit proefschrift)
De combinatie van beeldintensiteit en puntcorrespondentie op het bottenstel- sel maakt het mogelijk om robuuste en nauwkeurige registratieresultaten te behalen in studies met data van hele lichamen van muizen. (dit proefschrift) Een goede benadering voor het registreren van data van hele lichamen is om eerst alle structuren met hoog contrast te registreren en vervolgens de struc- turen met laag contrast te interpoleren door middel van een anatomisch weef- sel model. (dit proefschrift)
Voor een robuuste registratie van het hele bottenstelsel van een muis dient a priori informatie van anatomische beperkingen van gewrichten meegenomen te worden.
Een side-by-side visualisatie van corresponderende structuren in datasets van longitudinale studies maakt navigeren en kwantificeren van de data aan- zienlijk eenvoudiger.
Door aan de optimalisatiemaat een vormbeperking toe te voegen is het mogelijk om binnen een registratie met grote vormverschillen van de doelstructuren om te gaan.
Een uitgebreide evaluatie van een nieuwe methode voor de medische beeldan- alyse in combinatie met een passende statistische analyse van de resultaten zou een voorwaarde voor het publiceren in een serieus tijdschrift moeten zijn.
Did I request thee, Maker, from my clay to mould me Man? Did I solicit thee from darkness to promote me?
Adam to god in John Milton's ‘Paradise Lost’
Hulpverlening van overheden was en is nog steeds een onverminderd grote politieke, economische en humanitaire ramp voor het grootste deel van de ontwikkelingslanden. In het kort is het (wat Karl Kraus over het Freudianisme zei) de oorzaak van wat het de oplossing lijkt te zijn.
Dambisa Moyo in ‘Dead Aid’
De wereld zou vreedzamer zijn als mensen zich meer zouden richten op wat ze met elkaar gemeen hebben dan op onderlinge verschillen.
Persoonlijke vrijheid eindigt bij het schenden van die van anderen.
d 1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
