University of Groningen When synthetic cells and ABC-transporters meet Sikkema, Hendrik

University of Groningen

When synthetic cells and ABC-transporters meet

Sikkema, Hendrik

DOI:

10.33612/diss.136492038

IMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF) if you wish to cite from

it. Please check the document version below.

Document Version

Publisher's PDF, also known as Version of record

Publication date:

2020

Link to publication in University of Groningen/UMCG research database

Citation for published version (APA):

Sikkema, H. (2020). When synthetic cells and ABC-transporters meet. University of Groningen.

https://doi.org/10.33612/diss.136492038

Copyright

Other than for strictly personal use, it is not permitted to download or to forward/distribute the text or part of it without the consent of the author(s) and/or copyright holder(s), unless the work is under an open content license (like Creative Commons).

Take-down policy

If you believe that this document breaches copyright please contact us providing details, and we will remove access to the work immediately and investigate your claim.

Downloaded from the University of Groningen/UMCG research database (Pure): http://www.rug.nl/research/portal. For technical reasons the number of authors shown on this cover page is limited to 10 maximum.

Propositions

accompanying the dissertation

W

ABC-

by

Hendrik R. S

1. Proposition 1. - Energy is what keeps systems out of equilibrium, therefore its sup-ply should be the first and most important design aspect of a syntetic cell. (Chapter 1)

2. Proposition 2. - Understanding a system globally does not imply understanding of the details, and vice versa. Both are of importance when building a system from scratch. (Chapter 2)

3. Proposition 3. - Cyclic-di-AMP acts as an emergency brake in the ABC-transporter OpuA. (Chapter 3)

4. Proposition 4. - Theory and in vitro / in silico approaches become equivalent to the in vivo situation when we have a full understanding of the cell. Until then a seemingly simple modification, e.g. turning a homodimer into a heterodimer, remains a significant challenge. (Chapter 4)

5. Proposition 5. - Time investments in the present, often save time in the future. (Chapter 5)

6. Proposition 6. - Failures bring the knowledge, success is needed to keep one moti-vated.

7. Proposition 7. - Problem solving is interesting and exciting, having problems is not.

8. Proposition 8. - Collaboration multiplies either frustration or success, depending on the communication and amount of energy put in by all parties.

9. Proposition 9. - Science is limited by our imagination, therefore no limits should be imposed to our imagination.

10. Proposition 10. - The availability of a large toolbox is useless when one does not know how to use the tools.

Stellingen

behorende bij het proefschrift

W

ABC-

door

Hendrik R. S

1. Stelling 1. - Energie houdt systemen uit evenwicht, daarom zou energievoorzie-ning het eerste en meest belangrijke ontwerp onderdeel van een synthetische cel moeten zijn. (Hoofdstuk 1)

2. Stelling 2. - Een systeem globaal begrijpen betekent niet dat we de details begrij-pen en vice versa. Beide zijn van belang wanneer een nieuw systeem ontworbegrij-pen wordt. (Hoofdstuk 2)

3. Stelling 3. - Cyclisch-di-AMP fungeert als een noodrem op de ABC-transporter OpuA. (Hoofdstuk 3)

4. Stelling 4. - Theorie en in vitro / in silico benaderingen worden equivalent aan de

in vivo situatie wanneer we de cel volledig begrijpen. Tot dat moment zal een op

het oog eenvoudige aanpassing, zoals het veranderen van een homodimeer in een heterodimeer, een aanzienlijke uitdaging blijven. (Hoofdstuk 4)

5. Stelling 5. - Het investeren van tijd in het nu leidt vaak to besparing van tijd in de toekomst. (Hoofdstuk 5)

6. Stelling 6. - Mislukkingen brengen kennis, succes is nodig om gemotiveerd te blij-ven.

7. Stelling 7. - Problemen oplossen is interessant en leuk, problemen hebben niet. 8. Stelling 8. - Samenwerking vergroot ofwel frustratie of succes, afhankelijk van de

communicatie en de hoeveelheid energie die door alle partijen in de samenwer-king wordt gestopt.

9. Stelling 9. - De wetenschap is gelimiteerd door onze verbeelding, daarom zouden we geen grenzen aan onze verbeelding moeten stellen.

10. Stelling 10. - Goed gereedschap is waardeloos wanneer men niet weet hoe het te gebruiken.