Compiling reference
populations DNA typing
Selecting informative SNPs Detecting probability settings STRUCTURE software Testing known pure- and crossbreds Validation
DNA-test voor ras-identificatie van de zeldzame
Nederlandse runderrassen.
Financiering
Dit onderzoek is gefinancierd door het ministerie van Landbouw, Natuur en Voedselkwaliteit (WOT-03-003-056).
Ina Hulsegge, Mira Schoon, Jack Windig, Marjolein
Neuteboom, Sipke Joost Hiemstra and Anouk Schurink, 2019, Livestock Science 223:60-67
Een totale referentiepopulatie van 572 raszuivere runderen met bekende afstammingsgegevens, van 6 oorspronkelijke
Nederlandse dubbeldoelrassen en het Holstein Friesian ras.
Op basis van de 133 geselecteerde SNPs kunnen de verschillende rassen worden geïdentificeerd.
STRUCTURE wijst 88,9% van de dieren toe aan het juiste ras op basis van aangegeven referentiepopulaties.
Het vergroten van de raszuivere fokpopulaties van de zeldzame Nederlandse dubbeldoel rundderrassen.
Het ontwikkelen van een makkelijk uit te voeren en betrouwbare DNA-test voor ras-identificatie van runderen met (deels)
missende stamboomgegevens en ongeregistreerde dieren.
Foto’s: Veeteelt en CGN
Doel Werkwijze
Resultaten
Stamboeken zijn ooit opgezet om populaties bij te kunnen houden, om de raskenmerken te beschermen en om
stamboomgegevens terug te vinden. Veel van de Nederlandse dubbeldoel runderrassen hebben een dermate laag aantal
geregistreerde, raszuivere vrouwelijke fokdieren dat zij een
zeldzame status hebben. Het toevoegen van ongeregistreerde dieren zou de situatie kunnen verbeteren, maar is vaak niet
mogelijk door (deels) ontbrekende afstammingsgegevens.
Een DNA-test waarmee het ras van ongeregistreerde runderen
kan worden geïdentificeerd kan hierbij uitkomst bieden. Wanneer de DNA-test aantoont dat een rund tot een bepaald ras hoort, kan dit rund worden opgenomen in het stamboek om zo de raszuivere populatie te vergroten.
Achtergrond
Nederlandse dubbeldoel rassen
De DNA-test wordt via onderstaand protocol ingezet in de
praktijk. De eerste dieren, met een positieve uitslag van de DNA-test, zijn aan de raszuivere populaties toegevoegd en door de
stamboeken opgenomen.
De praktijk
Ina Hulsegge, Mira Schoon, Jack Windig, Sipke-Joost Hiemstra en Anouk Schurink.
Wageningen University & Research, Centrum voor Genetische bronnen, Nederland (CGN), Postbus 338, 6700 AH Wageningen Ina.hulsegge@wur.nl, +31 (0)317 48 05 06, www.wur.nl/cgn Groninger Blaarkop Roodbont Friesvee Brandrode rund Fries Hollands Lakenvelder Maas-Rijn-IJsselvee 50% 100% 75% 75% 100% 50% ? ? ? ? 1. Samenstellen
referentiepopulaties 2. DNA genotypering 3. Selectereninformatieve SNPs
4. Testen instellingen
STRUCTURE software 5. Valideren van uitslagen
met bekende raszuivere en kruisling runderen 6. Testen van dieren met
(deels) onbekende
afstammingsgegevens
Protocol DNA-test
1. Identificatie rund door rasorganisatie 2. Controle van raskenmerken
3. DNA onderzoek
4. Opname in stamboek
Conclusie
Er is een makkelijk uit te voeren en betrouwbare DNA-test
ontwikkeld voor rasidentificatie van de Nederlandse dubbeldoel runderrassen.
