• No results found

VirD2 of Agrobacterium tumefaciens : functional domains and biotechnological applications

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Share "VirD2 of Agrobacterium tumefaciens : functional domains and biotechnological applications"

Copied!
3
0
0

Bezig met laden.... (Bekijk nu de volledige tekst)

Hele tekst

(1)

VirD2 of Agrobacterium tumefaciens : functional domains and biotechnological applications

Kregten, M. van

Citation

Kregten, M. van. (2011, May 19). VirD2 of Agrobacterium tumefaciens : functional domains and biotechnological applications. Retrieved from https://hdl.handle.net/1887/17648

Version: Corrected Publisher’s Version

License: Licence agreement concerning inclusion of doctoral thesis in the Institutional Repository of the University of Leiden

Downloaded from: https://hdl.handle.net/1887/17648

Note: To cite this publication please use the final published version (if applicable).

(2)

Stellingen

behorende bij het proefschrift

VirD2 of Agrobacterium tumefaciens: functional domains and biotechnological applications

1. De beschreven interacties tussen VirD2 en de cyclophilines Roc1 en CypA uit Arabidopsis thaliana zijn waarschijnlijk niet biologisch relevant.

Dit proefschrift.

Deng et al. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 7040-7045.

2. Het DUF domain van VirD2 zorgt voor lokalisatie van het T-complex aan de celpolen van Agrobacterium tumefaciens.

Dit proefschrift.

3. Het T4SS van Agrobacterium tumefaciens kan gebruikt worden om zeer verschillende eiwitten in plantencellen te brengen.

Dit proefschrift.

4. Homing endonucleases zijn - na fusie aan VirD2 en na passage door het T4SS van Agrobacterium tumefaciens - nog steeds in staat tot het maken van dubbelstrengs breuken in genomisch DNA.

Dit proefschrift.

5. Horizontale gentransfer levert een belangrijke bijdrage aan het vermogen van bacteriën om zich aan te passen aan hun omgeving.

Frost et al. (2005) Nat. Rev. Microbiol.3: 722-732. , McDaniel et al. (2010) Science. 330: 50.

6. Uit de resultaten van Tanaka et al. kan niet worden geconcludeerd dat gene targeting is opgetreden.

Tanaka et al. (2010) Biochem. Biophys. Res. Commun. 396: 289-293.

(3)

7. Het is opmerkelijk dat Zaltsman et al. om eiwitoverdracht van VBF aan te tonen, VBF hebben gefuseerd met het C-terminale einde van VirE3 in plaats van dat van VirF, omdat uit eerder onderzoek gebleken is dat het C-terminale einde van VirF effi ciënter is in het mediëren van eiwitoverdracht.

Schrammeijer et al. (2003) Nucleic Acids Res. 31:860-868., Zaltsman et al.

(2010) Cell. Host & Microbe. 7: 197-209.

8. Voor het begrijpen van hoe een genoom in elkaar zit, is zowel de sequentie van het genoom als functionele analyse van individuele genetische elementen nodig.

Galperin and Koonin (2010) Trends in Biotechnol. 28: 398-406.

9. Onderzoek doen aan Agrobacterium tumefaciens kan ook leiden tot de vorming van groene vingers bij de onderzoeker.

10. Wetenschappelijk onderzoek moet beter uitgelegd worden aan het grote publiek en hier moeten wetenschappers een grotere rol bij spelen.

11. Geslaagd wetenschappelijk onderzoek doen is ook een kwestie van geluk hebben.

12. De adressering “aan de bewoners van dit huis” op reclamemateriaal is niet specifi ek genoeg om bezorging te rechtvaardigen bij huizen met een nee/nee-sticker.

Maartje van Kregten 9 december 2010

Referenties

GERELATEERDE DOCUMENTEN

Th e fact that the translocation signal of an unrelated protein can restore T-strand transformation provides further evidence that T-strand translocation is protein-driven,

De vinding dat het translocatiesignaal van een eiwit dat niet verwant is aan VirD2, wel de translocatie van de T-streng kan herstellen, is bewijs dat de translocatie van VirD2 en de

Tijdens haar studie liep zij stages bij de vakgroep Toxicologie van het Leiden Amsterdam Centre for Drug Research, bij de vakgroep Moleculaire Genetica van het Leiden Institute

“Agrobacterium Infection: Translocation of Virulence Proteins and Role of VirF in Host Cells” by Esmeralda Jurado Jácome. The research described in this thesis was

The genes for opine catabolism are located on the Ti- plasmid in a region adjacent to the genes required for conjugation (tra and trb genes) and vegetative replication (rep),

In order to test whether VirD2, VirE1 and VirE3 are translocated effector proteins, we used the CRAfT assay with Arabidopsis line 3043 (Vergunst et al., 2000), in which

DNA from only two of the three cDNA clones that were positive for ASK1 with PCR showed a hybridization signal in the dot blot assay (data not shown). Summarizing,

To identify the VirF sequence involved in substrate interaction, progressive N-terminal deletions of VirF were tested in in vitro GST pull down assays for