UvA-DARE is a service provided by the library of the University of Amsterdam (https://dare.uva.nl)
UvA-DARE (Digital Academic Repository)
Expression profiling in head and neck cancer: Predicting response to
chemoradiation
Pramana, J.
Publication date
2014
Document Version
Final published version
Link to publication
Citation for published version (APA):
Pramana, J. (2014). Expression profiling in head and neck cancer: Predicting response to
chemoradiation.
General rights
It is not permitted to download or to forward/distribute the text or part of it without the consent of the author(s)
and/or copyright holder(s), other than for strictly personal, individual use, unless the work is under an open
content license (like Creative Commons).
Disclaimer/Complaints regulations
If you believe that digital publication of certain material infringes any of your rights or (privacy) interests, please
let the Library know, stating your reasons. In case of a legitimate complaint, the Library will make the material
inaccessible and/or remove it from the website. Please Ask the Library: https://uba.uva.nl/en/contact, or a letter
to: Library of the University of Amsterdam, Secretariat, Singel 425, 1012 WP Amsterdam, The Netherlands. You
will be contacted as soon as possible.
appendICes
Curriculum vitae
list of publications
dankwoord
Appendices
128
CurrICulum vItae
Jimmy Pramana was born on June 2nd 1981 in Brussels, Belgium.
After graduating from the Ignatius Gymnasium in Amsterdam in 1998, he attended Medical School at the VU University in Amsterdam, where he received his medical degree in October 2004. He worked as a surgical resident at the Antoni van Leeuwenhoek hospital and in March 2005 he continued working there as a PhD-student on the research project described in this thesis. In May 2007 he started his Ear- Nose- and Throat Residency at the Academic Medical Centre in Amsterdam under supervision of Prof. Dr. W.J. Fokkens and Prof. Dr. S.B. van der Baan. During his training rotations were done at the Kennemer Gasthuis, Onze Lieve Vrouwe Gasthuis and Antoni van Leeuwenhoek ziekenhuis under supervision of J. Velthuizen, Dr. E. van Deelen and Prof. Dr. A.J.M. Balm. He completed his training May 2012. He now works as an ENT surgeon in Tergooi Ziekenhuizen, Hilversum/ Blaricum.
Jimmy comes from a family of medical practitioners. His father Tommy, is a dentist and his mother Vonny, a physician. They immigrated from Indonesia to the Netherlands in the seventies. His sister Angela, is also a dentist.
During his teen years he played tennis at a competitive level, resulting in top 20 national junior rankings. After this he became a licensed teaching tennis professional.
He lives in Amstelveen and is married to Jessica, who also works as a dentist. They are the proud parents of Emma (2011, future pro/dentist) and Lucas (2013,future tennis-pro/ENT surgeon).
129
A
pramana J, Mooren JJ, de Jong MC, van den Brekel MW, van Velthuysen ML, Pirens T,
Haesevoets A, Kremer B, Begg AC, Speel EJM
‘’EGFR expression predicts unfavourable survival in advanced HPV-positive oropharyngeal cancer treated with chemoradiation’’
submitted
de Jong MC, pramana J, van der Wal JE, Lacko M, Peutz-Kootstra CJ, de Jong JM,
Takes RP, Kaanders JH, van der Laan BF, Wachters J, Jansen JC, Rasch CR, van Velthuysen ML, Grénman R, Hoebers FJ, Schuuring E, van den Brekel MW, Begg AC.
“CD44 expression predicts local recurrence after radiotherapy in larynx cancer’’
Clinical Cancer Research. 2010
pramana J, de Jong MC, Knegjens JL, Balm AJ, van den Brekel MW, Hauptmann
M, Begg AC, Rasch CR
“HPV and high-risk gene expression profiles predict response to chemoradiotherapy in head and neck cancer, independent of clinical factors”
Radiotherapy and Oncology 2010
Eschrich SA, pramana J, Zhang H, Zhao H, Boulware D, Lee JH, Bloom G, Rocha-Lima C,
Kelley S, Calvin DP, Yeatman TJ, Begg AC, Torres-Roca JF.
“A gene expression model of intrinsic radiosensitivity: prediction of response and prognosis after chemoradiation”
International Journal of radiation oncology, biology and physics, 2009
pramana J, van den Brekel MWM, van Velthuysen MLF, Wessels LFA, Hofland I, Atsma D, Pimentel N, Hoebers FJP, Rasch CRN, Begg AC
“Gene expression profiling to predict outcome after chemoradiation in head and neck cancer”
International Journal of radiation oncology, biology and physics, 2007
pramana J, Pimentel N, Hofland I, Wessels LFA, van Velthuysen MLF, Atsma D,
Rasch CRN, van den Brekel MWM, Begg AC
“Heterogeneity of gene expression profiles in head and neck cancer”
Appendices
130
dAnkWoord
Jaren na mijn start als arts-onderzoeker op het NKI-AvL, op de afdeling Experimentele Therapie is het boekje eindelijk af. Opluchting, trots, en verdriet spelen door mijn hoofd. Dit boekje was er nooit geweest zonder de hulp van velen. Ik wil ze hier heel graag voor bedanken.
Lieve Adrian †,
Jij bent de belangrijkste persoon geweest voor mij tijdens dit promotietraject. Al die jaren, ook na mijn periode in het NKI-AvL, heb je me begeleid. Zonder jou, was het nooit gelukt. Ik mis onze gesprekken over onderzoek, maar met name over alles daarbuiten. Het voelt niet compleet zonder jou. Het is zo oneerlijk…..
Beste Michiel,
Geduld, dat heb je met mij gehad na mijn periode in het NKI-AvL. Je hebt me wel altijd het gevoel gegeven dat ik het proefschrift af kon maken. Je bent altijd een voorbeeld voor mij geweest en ik ben erg blij dat je mijn promotor bent.
Beste Fons,
Mijn carrière begon bij jullie als keuze co-assistent en ANIOS. Als hoofd van de afdeling heb je mij toen het vertrouwen gegeven om verder te gaan in de KNO. Ik ben dankbaar voor de kans die je mij toen hebt gegeven.
Beste Coen,
Bij besprekingen was jij altijd kritisch en ‘to the point’. Ik heb jouw inbreng altijd als zeer belangrijk ervaren en dank je hier hartelijk voor.
Ook de overige commissieleden Prof. Ludi Smeele, Prof. Marcel Verheij, Prof. Mark van de Vijver, Prof. Ruud Brakenhoff en Dr. Volkert Wreesmann wil ik danken voor de tijd en moeite die ze hebben genomen om mijn proefschrift te bestuderen en zitting te nemen in deze commissie.
Beste Loes,
Gedurende de jaren hebben we regelmatig om de tafel gezeten en vele coupes bekeken. Jij hebt me veel geleerd en zonder jouw hulp hadden we veel van de studies niet kunnen doen. Bedankt hiervoor.
131
A
Adrian wees mij toe aan jou en dankzij jou heb ik een en ander op het lab onder de knie gekregen. Ook in de jaren erna stond je altijd voor me klaar. Hoe vaak heb je mij niet binnengelaten in het NKI omdat mijn pasje het niet meer deed?Lieve Sari,
Jij bent altijd een voorbeeld voor mij geweest als onderzoeker. Hard werken, nooit opgeven, kritisch op jezelf, maar ook tijd voor leuke dingen. Het was erg gezellig en denk nog vaak terug aan onze gesprekken.
Lieve Monique,
Vanaf het moment dat je op H6 kwam was duidelijk dat het vervolgproject op jouw lijf geschreven was. Een deel van dit proefschrift heb ik dan ook te danken aan jou. Succes met de laatste loodjes van jouw proefschrift.
Mijn overige kamergenoten, Manon, Conchita en Debbie wil ik bedanken voor 2 jaar lang vrouwenpraat op de kamer…..een kippenhok was er niks bij…;-)
De overige collega’s van het toenmalige H6, bedankt voor alle afdelingsuitjes, kerstdiners, squashtoernooien en borrels.
Beste Wytske en Bert,
Jullie zijn verantwoordelijk geweest voor mijn opleiding tot KNO-arts.
Wytske, jij hebt mij aangenomen; ik zal je altijd dankbaar zijn voor deze mogelijkheid. Bert, jij heb mij uiteindelijk afgeleverd als KNO-arts; jouw frisse blik op zaken heeft mij veel goed gedaan.
Alle arts-assistenten KNO met wie ik in het AMC heb gewerkt wil ik bedanken voor een mooie opleidingstijd. Je maakt leuke en minder leuke dingen mee als assistent, maar nu ik een tijdje weg ben, koester ik met name de leuke dingen.
Beste Jeroen en Ernst-Jan,
De laatste loodjes wegen het zwaarst. De HPV-studie was zonder “Maastrichtse invloed’’ nooit voltooid. Bedankt!
Appendices
132
Beste Bas, Liane, Hans en Peter,
Ik ben blij met jullie als maten. Laten we vooral zo doorgaan en KNO Tergooi naar een nog hoger niveau tillen! Ik ben er klaar voor!
Lieve paranimfen,
Johan, al meer dan 20 jaar zijn we beste vrienden. We hebben veel met elkaar meegemaakt. En eigenlijk met name leuke dingen! Ik ben er trots op dat jij aan mijn zijde staat vandaag. Gwijde, Ik had nooit gedacht dat ik er ‘op oudere leeftijd’ nog zo een goede vriend bij zou krijgen, maar dat is toch gebeurd! Laten we elkaar zoveel mogelijk ‘buiten de KNO’ blijven zien.
Lieve Angela, Ben, Anna en Thomas,
Ik kan me geen lievere zus, zwager, neefje en nichtje bedenken. Al vanaf mijn vroege jeugd ben jij er altijd voor me geweest Angela. Met Ben en de kinderen erbij is de band alleen maar sterker geworden. Jullie staan altijd voor mij klaar.
Lieve Papa en Mama,
Zonder jullie stond ik nu niet hier. Jullie waren en zijn een voorbeeld voor mij. Jullie hebben mij geleerd om hard te werken en gedisciplineerd te zijn, maar met name om te proberen een goed mens te zijn. ik ben erg trots op jullie en ik hou heel veel van jullie. Lieve Jessica,
Jij kent mij als geen ander, en in tijden dat ik het soms niet meer zie zitten, ben jij er altijd om me op te vrolijken, maar ook om mij een spiegel voor te houden. Dank je voor je onvoorwaardelijke steun en liefde.
Lieve Emma en Lucas,
Jullie zijn zo mooi en lief. Papa en mama boffen maar met jullie! Sinds jullie er zijn is ons leven nog mooier.
133
Appendices
134
Color seCtIon
Chapter 2 figure 4 page 31. Permutation test of the within-pair-between-pair-scatter ratio (WPBSR).
The histogram shows the distribution after randomly pairing biopsies, repeated 5000 times. The red line represents the WPBPSR of the matched biopsy pairs (WPBPSR = 0.55), showing a highly significant difference from the random pairings (p < 0.00001).
Chapter 4 figure 1 page 68. Radiosensitivity index (RSI) is correlated with clinical response to
concurrent radiochemotherapy in rectal andesophageal cancer patients. (A) The mean predicted RSI of responders is significantly lower than in nonresponders in both clinical cohorts (esophageal: p = 0.05, rectal: p = 0.03). (B) Predicted RSI of each individual patient in the cohorts (combined: p = 0.001511).
135
A
(B) an HPV16-positive OPSCC with a punctated FISH pattern, (C) an HPV-negative OPSCC with strong EGFR immunostaining of the tumour cell membranes and (D) an HPV-positive, EGFR negative OPSCC.
